Анализ на активността на неутрализиране на антитела срещу варианти на SARS-CoV-2 и сезонни човешки коронавируси NL63, HKU1 и 229E, индуцирани от три различни платформи за ваксина срещу COVID-19
Oct 26, 2023
Резюме: Коронавирусните инфекции, кулминиращи в скорошната пандемия от тежък остър респираторен синдром коронавирус 2 (SARS-CoV-2), започваща през 2019 г., подчертаха важността на ефективните ваксини за предизвикване на отговор на антитела с кръстосано неутрализираща активност. Ваксините срещу COVID-19 са разработени бързо, за да се намали тежестта на инфекциите със SARS-CoV-2 и тежестта на заболяването. Има хипотеза за кръстосана защита от сезонни инфекции с човешки коронавирус (hCoV), но все още е спорна. Тук изследвахме неутрализиращата активност срещу предшественика на SARS-CoV-2 и тревожните варианти (VOCs) при индивиди, ваксинирани с две дози BNT162b2, mRNA-1273 или AZD1222, със или без история на SARS-CoV-2 инфекция. Антитяло неутрализиращата активност срещу SARS-CoV-2 и VOCs е по-висока при BNT162b2-ваксинирани субекти, които преди това са били заразени със SARS-CoV-2 и са осигурили широкоспектърна защита. Вариантът Omicron BA.1 беше най-устойчивият сред ЛОС. Ваксинацията срещу COVID-19 не предостави защита срещу hCoV-HKU1. Обратно, антителата, индуцирани от ваксинация с mRNA-1273, показаха повишаване на тяхната неутрализираща активност срещу hCoV-NL63, докато ваксинацията с AZD1222 увеличи неутрализацията на антитялото срещу hCoV-229E, което предполага потенциални разлики в антигенността и имуногенността на различните шипове конструкции, използвани между различни платформи за ваксиниране. Тези данни предполагат, че може да има споделени епитопи между шиповите протеини на HCoV и SARS-CoV-2.
Ключови думи: SARS-CoV-2; сезонен; HKU1; 229E; NL63; неутрализиране
cistanche tubulosa - подобряват имунната система
1. Въведение
През декември 2019 г. огнището на нов коронавирус, наречен тежък остър респираторен синдром коронавирус 2 (SARS-CoV-2), бързо се разпространи по света, което доведе до глобална пандемия [1]. Оттогава международните усилия за генериране на подходящ терапевтик доведоха до разработването на множество платформи за ваксиниране и други антивирусни фармацевтични продукти. Постепенното нарастване на вариантите има намалено въздействие върху ефикасността на неутрализиращи антитела, натрупани или от предишна инфекция на SARS-CoV-2, или от ваксинация [2,3]. Световната здравна организация (СЗО) е категоризирала обезпокоителните варианти като варианти, предизвикващи безпокойство (VOC), докато други варианти, които не отговарят на същите критерии, попадат във варианти от интерес (VOI) или варианти в процес на изследване (VUI). Имаше значителен фокус върху вариантите и техните характеристики, като избягване на антитела и скорости на репликация, с много проучвания, сравняващи варианти и способността им да бъдат неутрализирани [4–8], докато пандемията продължава да напредва.
cistanche tubulosa - подобряват имунната система
SARS-CoV-2 принадлежи към семейство Coronaviridae, което включва SARS-CoV-1 [9], близкоизточен респираторен вирус (MERS) [10] и четири човешки коронавируса 229E, HKU-1 , NL63 и OC43 [11] (Фигура 1A). Докато SARS-CoV-1 и MERS са имали огнища, които са причинили тежко заболяване при хората [12], четирите други коронавируса, обикновено наричани сезонни или човешки коронавируси (HCoV), обикновено причиняват леко заболяване, подобно на обикновена настинка [11,13]. В редки случаи обаче HCoV могат да причинят тежки заболявания [14–16]. SARS-CoV-2, заедно с NL63, използва ангиотензин-конвертиращия ензим 2 (ACE2) като основен клетъчен рецептор [17,18]. Въпреки че HKU1 и OC43 са по-тясно свързани със SARS-CoV-2, те се свързват със сиаловите киселини като начин на навлизане [19], докато по-отдалеченият 229E използва човешка аминопептидаза (hAPN) [20]. (Фигура 1B).
Фигура 1. Филогенетично дърво на членовете на семейство Coronaviridae. * обозначава шипове протеини, които са използвани в това проучване (A). Структури на шипови протеини на SARS-CoV-2 и три от сезонните HCoV; HKU1, NL63 и 229E, които бяха използвани в това проучване (B). (PDB кодове: 6VXX, 60HW, 6U7H, 5I08 и 5SZS). Сивото обозначава S2 домейна, докато светло синьото е N-терминалният домейн на S1 субединицата, а тъмносиньото представлява останалата S1 субединица. NL63 има допълнителен участък в синьо-зелен цвят, представляващ уникален регион в домейна S1, който не се наблюдава при други коронавируси [21].
В началото на пандемията имаше дебат относно възможността антителата, създадени срещу HCOV, да имат някаква роля в защитата срещу SARS-CoV-2 [22–25]. Оттогава нарастващият интерес към HCoV доведе до увеличаване на разбирането на имунния отговор, който генерират. Няколко публикации, които изследват ефекта на HCoV, разчитат на използването на анализи на свързване като ензимно-свързани имуносорбентни анализи (ELISA), които измерват свързването на антитела, но не изясняват техните неутрализиращи способности. Нещо повече, успешното генериране на различни платформи за ваксини е използвано за защита на индивидите от инфекция и тежко заболяване [26], въпреки че тяхната ефективност намалява с появата на по-нови и по-избягващи имунитета варианти [27]. Тук използваме базирани на лентивируси псевдотипирани вируси на SARS-CoV-2, VOCs/VOI и HCoVs, за измерване на силата на неутрализиращи антитела, индуцирани от две дози BNT162b2 (Pfizer), AZD1222 (Astrazeneca), или иРНК-1273 (Moderna) срещу SARS-CoV-2 и варианти B.1.1.7 (алфа), B.1.351 (бета), P.1 (гама), B.1.617.2 ( Delta), B.1.525 (Eta) и B.1.1.529 (Omicron BA.1) (Фигура 2) и дали някоя от тези ваксини е в състояние да увеличи неутрализиращите антитела срещу HCoVs 229E, HKU1 или NL63.
Фигура 2. Шипове мутации на варианти на SARS-CoV-2, използвани в това проучване.
2. Материали и методи
2.1. Вземане на серумен пациент/Информация за етиката
Серумни проби бяха събрани от 36 здрави ваксинирани субекта. Проучването е одобрено от Комитета по етика на научната болница San Raffaele (протокол номер 68/INT/2020). Всички включени пациенти са дали писмено информирано съгласие.
2.2. Филогенетично дърво и схема за сходство
Филогенетична реконструкция с максимална вероятност, базирана на подравняването на кодон на шиповия ген, беше конструирана с помощта на дърво (версия 1.6.12) [28] с 10 000 ултра-бързи първоначални реплики [29] и TVM+F+I +G4 заместващ модел, избран чрез ModelFinder [30]. Диаграмата за сходство на последователностите беше конструирана чрез подравняване на пикови протеинови последователности на SARS CoV-2 (QHD43416.1), HKU1 (YP_173238.1) 229E (NP_073551.1) и NL63 ( YP_003767.1), използвайки mat (версия 7.453) [31] (опция за двойка гени) и визуализиран с помощта на пакета D3 JavaScript, внедрен в observable (https://observablehq.com/@spyros-lytras/seasonal cov -spike, достъпен на 3 ноември 2022 г.).
2.3. Тъканна култура
Човешки ембрионални бъбречни 293T/17 (HEK293T/17) клетки и човешки хепатоцити Huh- 7 клетки се поддържат в DMEM, допълнен с 10% фетален говежди серум и 1% пеницилин/стрептомицин. Клетки от китайски овариален хамстер (CHO) се поддържат в F12 на Ham, допълнен с 10% фетален волски серум и 1% пеницилин/стрептомицин. Клетките бяха рутинно пасирани, за да се предотврати сливането чрез промиване с буфериран с фосфат физиологичен разтвор и отделяне с трипсин-EDTA. Всички клетки се инкубират при 37 ◦C и 5% CO2.
растение цистанче, повишаващо имунната система
2.4. Псевдотипно производство на вируси
Всички псевдотипове (PV) са генерирани, както е описано по-горе [32]. Накратко, 1000 ng от pc-DNA 3.1+ плазмид, носещ шипа на предшественика на SARS-CoV-2, варианти Алфа, Бета, Делта, Гама, Ета, Omicron Ba. 1, или HCoVs 229E, HKU1 и NL63 се смесва с 1000 ng от p8.91 плазмид, кодиращ HIV Gag-pol и 1500 ng от pCSFLW плазмид, съдържащ репортерния ген на луцифераза на светулка Renilla и ко-трансфектиран върху HEK293T клетки при 50% сливане в T-75 колби с помощта на FuGENE-HD. HKU-1 изисква допълнителна стъпка на добавяне на 1,5 U екзогенна невраминидаза (Sigma) в 10 mL допълнен DMEM 24 часа след трансфекцията. За да се съберат псевдотипираните вируси, средата се аспирира 48 часа след ден на трансфекция и се филтрува с помощта на 0.45 µm филтър от целулозен ацетат. Всички PVs бяха разделени на аликвоти и съхранени при -80 ◦C за съхранение. След многократни опити не успяхме да псевдотипираме HCoV OC43.
2.5. Титруване на псевдотип вирус
Всички PVs бяха титрувани, както е описано по-горе [32]. Прицелните клетки за SARS-CoV-2, варианти и HCoV NL63 бяха приготвени в деня преди титруването чрез трансфектиране на ACE-2 и TRSSMP2. СНО клетките бяха използвани като клетки-мишени за HKU-1, а клетките Huh-7 бяха използвани като клетки-мишени за 229E. Накратко, 50 µL събран PV бяха добавени в горния ред на бяла плака с F-дънна 96-ямка (Nunc) и серийно разредени с помощта на DMEM или F-12 на Ham за HKU-1 PVs на половин стъпки до долния ред на плаката преди добавяне на 10 000 целеви клетки във всяка ямка. Плаките се връщат в инкубатора за 48 часа преди лизис с Bright-Glo реагент и анализ на активността на луциферазния репортерен ген в относителни линейни единици (RLU) с помощта на луминометър Glo-Max. PV титрите се отчитат в RLU/mL.
cistanche tubulosa - подобряват имунната система
Щракнете тук, за да видите продуктите Cistanche Enhance Imunity
【Попитайте за повече】 Имейл:cindy.xue@wecistanche.com / Whats App: 0086 18599088692 / Wechat: 18599088692
2.6. Анализи на псевдотип микронеутрализиране (pMN).
pMN анализът се провежда, както е описано по-горе. Накратко, реконвалесцентните серуми бяха смесени или с DMEM, или с F-12 на Ham при първоначално разреждане 1:40 и след това серийно разредени 2-нагънати в бяла плака с плоско дъно 96-ямки до окончателно разреждане 1:5120. Всички проби бяха повторени в два екземпляра. След това към всяка ямка се добавят PVs при вход от 1 × 106 RLU/mL. Плаките се връщат в инкубатора за тъканни култури за 1 час, преди добавянето на предварително трансфектирани ACE-2/TRSSMP2 HEK293T прицелни клетки или CHO клетки за HKU-1 и Huh-7 клетки за 229E, при плътност от 1 × 104 клетки на ямка. Плаките се връщат в инкубатора за 48 часа преди лизис с Bright-Glo реагент и анализ на активността на луциферазния репортерен ген в относителни линейни единици (RLU) с помощта на луминометър Glo-Max. IC50 бяха изчислени с помощта на софтуер GraphPad Prism 8, използвайки нелинейна регресионна крива, както е описано в [33].
2.7. Статистически анализ
Класираните тестове на Wilcoxon за съпоставени двойки бяха използвани за оценка на значимостта на съвпадащите субекти. Тестът Kruskal-Wallis ANOVA беше използван за оценка на значимостта при сравняване на IC50 титри между три ваксини. Всички тестове бяха използвани на софтуер GraphPad Prism 8.
3. Резултати
3.1. Кохортни характеристики
За оценка на неутрализиращия потенциал на SARS-CoV-2 специфични антитела срещу SARS CoV-2 VOCs и hCoVs, серуми, получени от двойно дозиран BNT162b2-ваксиниран (n=13), AZD1222-ваксинирани (n=16) и mRNA-1273-ваксинирани (n=7) индивиди със и без анамнеза за SARS-CoV-2 инфекция бяха инспектирани ( Маса 1).
Таблица 1. Демографски и клинични характеристики на кохортата.
3.2. Неутрализиране на варианти на SARS-CoV-2
Първо проведохме pMN анализи, за да анализираме степента на отговорите на неутрализиращи антитела срещу родовия SARS-CoV-2 и варианти, независимо от типа на ваксината (Фигура 3A). Нашите резултати показаха, че Omicron BA.1 е най-слабо неутрализираният VOC (24-кратно намаление, p =< 0.0001). As expected, we observed the samples from individuals with prior infection had higher neutralisation titers compared with immunologically naïve subjects. The serum from previously infected individuals (Figure 3B), neutralized the Alpha variant more effectively compared with the ancestral strain, as it showed a 1.3-fold decrease in median IC50 titre, followed by Eta and Delta variants, (3.4- and 4.5-fold decrease, respectively). Beta and Gamma variants were more resistant to neutralization (10.9- and 9.7-fold decrease, respectively), and Omicron BA.1 reached a 16.1-fold decrease compared with ancestral SARS-CoV-2. Notably, the majority of these subjects had received the BNT162b2 vaccine. Taken together, these results suggested that in vaccinated subjects the pre-existing immunity raised by natural infection with SARS-CoV-2, or a VOC is more effective in protecting against the spectrum of variants that emerged later over time, compared with immunity triggered by vaccination only. However, the recently emerged variants evolved mechanisms to evade the neutralizing antibody response.
Фигура 3. Способността на серумните антитела да неутрализират SARS-CoV-2 и ЛОС от индивиди, ваксинирани с две дози от BNT162b2, AZD1222 или иРНК-1273. Отговор на неутрализиращи антитела срещу предшественика на SARS-CoV-2 и варианти, при инфектирани преди това индивиди (синьо) и неинфектирани индивиди (червено), получаващи две дози или BNT162b2, AZD1222, или mRNA-1273 ваксини (A) . Статистическият анализ на тестовете за подписан ранг на Wilcoxon със съвпадащи двойки беше използван за сравняване на SARS-CoV-2 на предците с всеки вариант (A). Неутрализационни профили на серуми от BNT162b2-ваксинирани субекти с анамнеза за предишна инфекция. Не е използван статистически тест за BNT162b2 в панел C поради малкия размер на извадката с голяма вариация. (B). Профили на неутрализация на трите вида ваксини срещу варианти (C) и сравнение между платформите на ваксини. (D) Статистическият анализ на тестове за подписан ранг на Wilcoxon със съвпадащи двойки беше използван за сравняване на SARS-CoV-2 на предците с всеки вариант в панел C. ANOVA на Kruskal–Wallis беше използван за статистически анализ в панел D. ns {{23} } не е значимо, * p < 0.05, ** p < 0.01, *** p < 0,001, **** p По-малко от или равно на 0,0001.
След това анализирахме субекти, които не са преживели инфекция със SARS-CoV-2 преди прилагането на ваксината (Фигура 3C). Ефикасността на всяка платформа за ваксина беше анализирана по отношение на способността за неутрализиране както на родовия щам, така и на неговите варианти. Наблюдавахме, че серумите от BNT162b2-ваксинирани субекти имат високи средни IC50 титри в сравнение с тези, получени от иРНК-1273- и AZD1222-ваксинирани индивиди. Докато алфа вариантът не показва имунен бягство при нито един от ваксинираните субекти, всички ЛОС са резистентни към неутрализация на антитела в различна степен (Фигура 3C). Не успяхме да извлечем смислени резултати за значимост от пробите BNT162b2 поради няколко проби (n=5) с много голямо разпространение в IC50 титрите. Не наблюдавахме никаква статистически значима разлика между трите платформи за ваксини по отношение на техните способности да неутрализират вариантите Алфа, Ета, Бета, Гама и BA.1. Обратно, най-голямата разлика между трите вида ваксини се наблюдава при предшестващите и делта вариантите, тъй като иРНК-1273 показа съответно 1.6- и 1.4-кратно намаление на средните IC50 титри , в сравнение с BNT162b2, докато AZD1222 показа 3.8- и 4.1-кратно намаление (Фигура 3D).
3.3. Неутрализиране на сезонни HCoV
За да определим дали ваксинацията срещу SARS-CoV-2 може да осигури кръстосана защита срещу сезонни HCoV, попитахме дали предишна инфекция със SARS-CoV-2 е имала някакво въздействие върху антитяло-медиираната неутрализация на HCoV (Фигура 4A ). Не наблюдавахме статистически значими увеличения на неутрализиращите титри срещу 229E или HKU-1 между предишно заразени със SARS-CoV-2 и нелекувани индивиди. Обратно, статистически значимо намаление на неутрализиращите титри срещу NL63 след прилагане на втората доза е установено при ваксинирани субекти, преживели SARS-CoV-2 инфекция (p=0.033) в сравнение с нелекувани (p {{ 16}}.063). След това оценихме дали една или повече от платформите на ваксината ще повишат титрите срещу HCoVs при всички субекти, независимо от техния предишен статус на инфекция (Фигура 4B). Като цяло, при ваксинирани субекти, средните титри на неутрализация на антитела срещу NL63 са по-високи в сравнение с тези срещу 229E и HKU1, независимо от платформата на ваксината (Фигура 4B). По-специално, NL63 използва ACE2 като входен рецептор в целевите клетки, както и SARS-CoV-2. Типът ваксина не е оказал влияние върху засилването на неутрализиращите дейности срещу трите сезонни коронавируса, които изследвахме след прилагането на втората доза, с изключение на NL63 и HKU1. IC50 титрите срещу NL63 се повишават след втората доза с помощта на mRNA-1273 (p=0.03), докато 229E показва статистически значимо увеличение на IC50 титъра само при AZD1222-ваксинирани индивиди (p { {37}}< 0.001). Conversely, after the second boost of the BNT162b2 vaccine, neutralization titers against HCoV HKU-1 decreased, probably due to the selection of antigen-specific plasma cells with lower affinity for the HKU1 spike. To better understand the impact of COVID-19 vaccination on the protection from seasonal HCoVs in subjects with or without a history of SARS-CoV-2 infection, we analysed the spike protein similarity of HCoVs HKU1, NL63, 229E, and SARS-CoV-2 to investigate whether a particular region could explain the neutralization differences (Figure 4C). The similarity plot generated by comparing pairwise similarity showed HKU1 had higher similarity in all spike regions to the SARS-CoV-2 spike compared with 229E and NL63, consistent with the viruses' taxonomy. However, HKU1 seems to have extra insertions at the C-terminal end of the RBD compared with the other two seasonals and SARS-CoV-2. Furthermore, the S2 region shows much higher similarity to SARS-CoV-2 in all three HCoVs compared with the S1 region (Figure 4C).
Фигура 4. Сравнение на неутрализиращи отговори при HCoVs NL63, 229E и HKU1 между ваксинация с първа и втора доза срещу SARS-CoV-2. Профил на неутрализация срещу HCoVs NL63, 229E и HKU1 при двойно дозирани BNT162b2, mRNA-1273 или AZD1222 – ваксинирани субекти със или без анамнеза за SARS-CoV-2 инфекция. (А). Титри на неутрализиращи антитела срещу гореспоменатите HCoV след първата и втората доза на BNT162b2, mRNA{{20}} или AZD1222 ваксини. (B). Статистическият анализ на тестовете за подписан ранг на Wilcoxon със съвпадащи двойки беше използван в A и B. Графиките на сходство (C) показват, че скокът на HKU-1 има по-подобна аминокиселинна последователност на SARS-CoV-2 в сравнение с двете NL63 и 229E във всички региони на шиповия протеин. Прекъснатите линии в горната част показват сходство по двойки на аминокиселини между SARS-CoV-2 и 3 HCoV Spike протеини, изобразени с помощта на размер на прозореца от 400 аминокиселини и стъпка от 1. Позициите с пропуски бяха изключени от прозорците. Хоризонталните линии в долната част показват наличие на остатък за всеки от 4-те подредени коронавируса по цялата дължина на подравняването (наличие на цвят=присъствие на аминокиселина; липса на цвят=празнина). ns=не е значимо, * p < 0,05, *** p < 0,001.
4. Дискусия
В това проучване успяхме директно да сравним титрите на неутрализация на антителата, индуцирани от две ваксини, базирани на m-RNA, BNT162b2 и mRNA-1273, и ваксина, базирана на аденовирус, AZD1222, срещу SARS-CoV{{8} }, неговите появили се варианти и три сезонни HCoV. Нашите данни за неутрализиране на антитела срещу SARS-CoV-2 и неговите варианти при ваксинирани лица, със или без анамнеза за предишна инфекция, са в съответствие с това, което се съобщава в литературата [2,4,5,7,34–38 ]. Потвърдихме, че ваксинирането с две дози ваксини индуцира антитела, способни да неутрализират SARS-CoV-2 и ЛОС, като BNT162b2 предизвиква най-високи неутрализационни титри, следван от иРНК-1273 и AZD1222. Въпреки разликите им в неутрализационните титри, и трите ваксини са докладвани, че имат висока ефикасност при предотвратяването на тежък COVID-19 [39–41]. Вариантът Omicron BA.1 беше най-уклончивият от всички ЛОС, анализирани в това проучване (Фигура 3). Наистина, силно мутиралият шипов протеин на варианта BA.1 постави предизвикателства пред ефективността на настоящите ваксини за защита срещу COVID-19 и посочи необходимостта от наблюдение на защитата, предоставена срещу това и новопоявилия се SARS-CoV{ {31}} варианти, а именно Omicron BA.4 и BA.5. Двувалентни формулировки на базирани на иРНК ваксини, съдържащи както иРНК на шипа на предшественика на SARS-CoV-2, така и тази, обща между линиите BA.4 и BA.5, са проектирани и разрешени, за да се противодейства избягването на имунния отговор, предизвикан от оригиналния дизайн на ваксината.
HCoV са глобално разпространени и се смята, че индуцират краткотрайни защитни антитела [42]. Следователно има голяма вероятност повторното заразяване да остане повишено, особено през зимните периоди [13,43–45] въпреки високото сероразпространение [43,45,46]. Понастоящем се обсъжда дали предишна инфекция със сезонен HCoV предизвиква кръстосано реактивни антитела срещу SARS-CoV-2, и по-важното, дали това се превръща в защита срещу SARS-CoV-2. Кръстосано реактивни антитела [47–54] и Т-клетъчни отговори [55–61] бяха открити в предпандемични серуми и здрави донори; въпреки това подобни експериментални подходи са показали обратното от други изследователи [62]. В допълнение, в много от гореспоменатите статии, които разкриват кръстосано реактивни антитела в проби от преди пандемия, броят на кръстосано реактивните проби е малка част от общия анализиран серум, което предполага, че кръстосаната реактивност, въпреки че съществува, е ниска . Същият въпрос беше повдигнат относно антителата, предизвикани от ваксини срещу COVID-19, като проучванията показват кръстосано реактивни антитела към някои, но не към всички сезонни HCoV [63–65]. Показано е, че ваксинацията с шип протеин SARS-CoV-2 индуцира кръстосано реактивни антитела към алфа- и бетакоронавирусите при макаци [66]. Важно е да се заключи дали кръстосано реактивните антитела се превръщат в защитни, неутрализиращи антитела срещу SARS-CoV-2. Някои доклади предполагат, че въпреки че има малък тласък в антителата срещу HCoV по време на инфекция със SARS-CoV-2, те не са свързани със защита [67]. По подобен начин проучванията показват, че предишна инфекция с HCoVs не предпазва от SARS-CoV-2 инфекция и заболяване [68,69].
cistanche tubulosa - подобряват имунната система
Не открихме никакво повишаване на титрите на неутрализиращи антитела срещу HKU1 в нашата кохорта от SARS-CoV-2-субекти, независимо от техния SARS-CoV-2 преинфекциозен статус, с изключение на субекти, приложени с BNT162b2. Това е в контраст с два доклада, които наблюдават повишаване на титрите на HKU-1 след ваксинация срещу SARS-CoV-2 от BNT162b2 [63,64]. Хикс и др. показаха, че антителата, реагиращи на HCoV-OC43 и HCoVHKU1, имат минимална кръстосана реактивност със SARS-CoV-2, в съответствие с хомологията на последователността на тези протеини [54]. Освен това, предишна инфекция със SARS-CoV-2 не засили кръстосаната неутрализация нито срещу HKU1, нито срещу по-филогенетично свързания HCoV-229E (Фигура 4A). Един доклад предполага, че HKU1 може да има друг кандидат-рецептор, който все още не е идентифициран, поради наличието на предполагаем RBD, отдалечен от регионите на свързване на сиалова киселина [70,71]. Трябва също да се отбележи, че способността за неутрализиране може да зависи не само от сходството по двойки между аминокиселините в протеина, но и от къси вмъквания и делеции, които могат да променят структурната конформация на протеина. Например, специфичното вмъкване на HKU-1- в С-терминалния край на RBD (Фигура 4C) може частично да обясни нашите резултати от неутрализация. Обратно, ние открихме, че прилагането на втората доза при наивни субекти повишава защитния отговор на антитялото срещу NL63 в сравнение с този, получен при предишни инфектирани субекти, получаващи същата доза. Това вероятно се дължи на факта, че допълнителните експозиции на пиковия антиген не са имали ефект върху неутрализацията на антитялото срещу NL63.
Разликите в неутрализацията на антителата между HCoV може да се дължат на разликите в шиповете, използвани от платформите за ваксиниране. BNT162b27 кодира шип с пълна дължина с K986P и V987P мутационни места за стабилизиране на конформацията преди сливането на протеина [72]. Ваксината mRNA-1273 съдържа кодиращата последователност за шипов гликопротеин, стабилизиран от същите пролинови замествания, използвани във ваксината BNT162b2, с трансмембранна котва и непокътнато място на разцепване S1-S2. Конформацията преди сливането се стабилизира от последователните пролинови замествания, които са разположени в S2 субединицата в горната част на централната спирала [73]. Обратно, нативен пик се изразява от ваксината AZD1222. Тъй като на нашите нелекувани субекти беше приложена ваксината AZD1222, можем да спекулираме, че нативната форма на шиповия протеин е предизвикала развитието на по-високи титри на неутрализиращи антитела в сравнение с тези, индуцирани от стабилизирания преди сливане протеин. Обратно, втората имуногенна експозиция на пика на SARS-CoV-2 засили неутрализиращия отговор срещу NL63 или 229E (Фигура 4B), както беше докладвано по-рано [67], в зависимост от платформата на ваксината, независимо от предварителната статус на инфекция. Интересното е, че друг доклад наблюдава същата кръстосано неутрализираща активност, въпреки че това е независимо от платформата на ваксината [74]. Спекулираме, че може да възникне кръстосана реактивност поради сходството на епитопите в рецептор-свързващия мотив (RBM) на NL63 към SARS-CoV-2, тъй като и двата вируса споделят ACE-2 като техен входен рецептор [75 ]. По подобен начин се съобщава, че епитоп, припокриващ слетия пептид S2 в 229E, предизвиква кръстосана реактивност срещу SARS-CoV-2 [48]. Song и др. описват защитни неутрализиращи антитела, насочени към субдомейна S2 [53]. Освен това, доклад по време на първоначалното огнище на SARS-CoV-1 също откри кръстосано реактивни антитела срещу NL63 и 229E [76], укрепвайки хипотезата за споделени епитопи между алфакоронавирусите и бетакоронавирусите. S протеинът на NL63 не съдържа мястото за разпознаване на фурин и не се разцепва по време на биогенезата [77]. По подобен начин, шиповият протеин, експресиран от ваксината mRNA1273, няма място на разцепване; следователно, конформацията на протеина може да бъде подобна и може да задейства неутрализиращи антитела срещу споделени епитопи и които се подсилват след второ излагане на същия антиген.
Антигенната природа на шиповия протеин, експресиран от различните ваксини, заедно с множеството конформации, които те могат да придобият, може да повлияе на развитието на неутрализиращи антитела с различен афинитет към няколко епитопа в шиповия протеин. Тъй като шипът AZD-1222 не съдържа двете пролинови мутации, за да стабилизира неговия шип в тримерна структура преди сливане [78,79], наличието на шип след сливане може потенциално да предизвика по-голям имунен отговор към епитопи в домейна S2. Това може да обясни защо не наблюдаваме никакво повишаване на неутрализиращите титри срещу 229Е нито в базирани на иРНК, стабилизирани преди сливане имуногени, нито в ваксинирани проби. В крайна сметка, въпреки наблюдението на повишаване на титрите, за нас е невъзможно да кажем дали това се превръща в защитни титри, тъй като корелатите на защита срещу SARS-CoV-2 все още не са определени. В нашето проучване има няколко ограничения, които трябва да се вземат предвид. Нашите данни биха се възползвали от по-голям брой проби във всички типове платформи за ваксини и контролни проби от неваксинирани лица, които или са били заразени със SARS-CoV-2, или не. Освен това, ние не анализирахме базовите нива на кръстосано реактивни неутрализиращи антитела срещу сезонни коронавируси в нашата кохорта от ваксинирани субекти. Панкоронавирусна ваксина би предизвикала антитела, които разпознават и неутрализират широк спектър от коронавируси. Това е предизвикателство поради генетичната природа на тези РНК вируси, които често мутират и предизвикват имунитет, който отслабва с времето, увеличавайки вероятността от повторно заразяване. Следователно, идентифицирането на ключовите епитопи, разположени в най-съхранените региони на шиповия протеин, особено в S2 субединицата, е от значение за потенциално индуциране на неутрализиращи антитела с по-широк афинитет към клетъчните рецептори, които медиират навлизането на вируса. Бяха формулирани няколко кандидати за ваксина, а някои се основават на двойни антигени, включващи както шип, така и нуклеокапсид (N) компоненти [80]. Тези формулировки са на предклиничен етап, тъй като могат да осигурят по-широки и по-трайни хуморални и клетъчни имунни отговори срещу коронавируси [80].
Препратки
1. Джу, Н.; Джан, Д.; Wang, W.; Ли, X.; Янг, Б.; Песен, J.; Джао, X.; Хуанг, Б.; Shi, W.; Лу, Р.; et al. Нов коронавирус от пациенти с пневмония в Китай, 2019 г. N. Engl. J. Med. 2020, 382, 727–733. [CrossRef] [PubMed]
2. Алтман, DM; Бойтън, RJ; Beale, R. Имунитет към SARS-CoV-2 Варианти на загриженост. Наука 2021, 371, 1103–1104. [CrossRef] [PubMed]
3. Бурки, Т. Разбиране на вариантите на SARS-CoV-2. Lancet 2021, 397, 462. [CrossRef] [PubMed]
4. Гарсия-Белтран, WF; Lam, EC; Св. Дени, К.; Нитидо, АД; Гарсия, ZH; Хаузер, BM; Фелдман, Дж.; Павлович, MN; Григорий, DJ; Познански, MC; et al. Множество варианти на SARS-CoV-2 избягват неутрализацията чрез индуциран от ваксина хуморален имунитет. Cell 2021, 184, 2372–2383. [CrossRef] [PubMed]
5. Хофман, М.; Арора, П.; Грос, Р.; Seidel, A.; Hörnich, BF; Hahn, AS; Крюгер, Н.; Graichen, L.; Hofmann-Winkler, H.; Кемпф, А.; et al. SARS-CoV-2 Варианти B.1.351 и P.1 Бягство от неутрализиращи антитела. Cell 2021, 184, 2384–2393. [CrossRef]
6. Кантони, Д.; Майора-Нето, М.; Nadesalingam, A.; Wells, DA; Карнел, GW; Ohlendorf, L.; Ферари, М.; Палмър, П.; Чан, ACY; Smith, P.; et al. Йерархия на неутрализация на опасните варианти на SARS-CoV-2 Използването на стандартизирани, количествени анализи на неутрализация разкрива връзка с тежестта на заболяването; Към дешифриране на праговете на защитните антитела. Преден. Immunol. 2022, 13, 773982. [CrossRef]
7. Планас, Д.; Bruel, Т.; Гжелак, Л.; Guivel-Benhassine, F.; Старополи, И.; Поро, Ф.; Planchais, C.; Buchrieser, J.; Раджа, ММ; Бишъп, Е.; et al. Чувствителност на инфекциозни SARS-CoV-2 B.1.1.7 и B.1.351 варианти към неутрализиращи антитела. Нац. Med. 2021, 27, 917–924. [CrossRef]
8. Lustig, Y.; Zuckerman, N.; Немет, И.; Atari, N.; Kliker, L.; Regev-Yochay, G.; Сапир, Е.; Мор, О.; Alroy-Preis, S.; Менделсън, Е.; et al. Капацитет за неутрализиране срещу Делта (B.1.617.2) и други опасни варианти след ваксинация Comirnaty (BNT162b2, BioNTech/Pfizer) при здравни работници, Израел. Евронаблюдение 2021, 26, 2100557. [CrossRef]
9. Ksiazek, TG; Ердман, Д.; Голдсмит, CS; Заки, SR; Перет, Т.; Емери, С.; Тонг, С.; Urbani, C.; Comer, JA; Лим, В.; et al. Нов коронавирус, свързан с тежък остър респираторен синдром. Н. англ. J. Med. 2003, 348, 1953–1966. [CrossRef]
10. Заки, А.М.; van Boheemen, S.; Bestebroer, ТМ; Osterhaus, ADME; Фушие, RAM Изолиране на нов коронавирус от мъж с пневмония в Саудитска Арабия. Н. англ. J. Med. 2012, 367, 1814–1820. [CrossRef]
11. Лиу, DX; Liang, JQ; Фунг, TS човешки коронавирус-229E, -OC43, -NL63 и -HKU1 (Coronaviridae). В Енциклопедия по вирусология, 4-то издание; Bamford, DH, Zuckerman, M., Eds.; Academic Press: Оксфорд, Великобритания, 2021 г.; стр. 428–440. ISBN 978-0-12-814516-6.
12. де Вит, Е.; van Doremalen, N.; Falzarano, D.; Munster, VJ SARS и MERS: Последни прозрения за възникващите коронавируси. Нац. Rev. Microbiol. 2016, 14, 523–534. [CrossRef]
13. Гонт, ER; Харди, А.; Claas, ECJ; Симъндс, П.; Templeton, KE Епидемиология и клинични представяния на четирите човешки коронавируса 229E, HKU1, NL63 и OC43, открити в продължение на 3 години с помощта на нов мултиплексен PCR метод в реално време. J. Clin. Microbiol. 2010, 48, 2940–2947. [CrossRef]
14. Да Вейга, ABG; Мартинс, LG; Riediger, I.; Mazetto, A.; Debur, MdC; Gregianini, TS Повече от обикновена настинка: ендемични коронавируси OC43, HKU1, NL63 и 229E, свързани с тежка остра респираторна инфекция и смъртни случаи сред здрави възрастни. J. Med. Virol. 2021, 93, 1002–1007. [CrossRef]
15. Арден, КЕ; Nissen, MD; Слотове, TP; Mackay, IM Нов човешки коронавирус, HCoV-NL63, свързан с тежко заболяване на долните дихателни пътища в Австралия. J. Med. Virol. 2005, 75, 455–462. [CrossRef]
16. Ръка, Дж.; Роуз, Е.Б.; Салинас, А.; Лу, X.; Sakthivel, SK; Шнайдер, Е.; Watson, JT Избухване на тежко респираторно заболяване, свързано с човешки коронавирус NL63 в заведение за дългосрочни грижи. Emerg. заразявам. дис. 2018, 24, 1964–1966. [CrossRef]
17. Хофман, М.; Kleine-Weber, H.; Шрьодер, С.; Крюгер, Н.; Херлер, Т.; Erichsen, S.; Schiergens, TS; Herrler, G.; Wu, N.-H.; Nitsche, A.; et al. Навлизането на SARS-CoV-2 в клетките зависи от ACE2 и TMPRSS2 и се блокира от клинично доказан протеазен инхибитор. Cell 2020, 181, 271–280.e8. [CrossRef]
18. Хофман, Х.; Pyrc, K.; van der Hoek, L.; Geier, М.; Berkhout, B.; Pöhlmann, S. Човешки коронавирус NL63 използва коронавирусния рецептор на тежък остър респираторен синдром за клетъчно навлизане. Proc. Natl. акад. Sci. САЩ 2005, 102, 7988–7993. [CrossRef]
19. Hulswit, RJG; Lang, Y.; Bakkers, MJG; Li, W.; Li, Z.; Шоутен, А.; Ophorst, B.; van Kuppeveld, FJM; Boons, G.-J.; Bosch, B.-J.; et al. Човешките коронавируси OC43 и HKU1 се свързват с 9-O-ацетилирани сиалови киселини чрез запазено рецепторно-свързващо място в домейна на шиповия протеин A. Proc. Natl. акад. Sci. САЩ 2019, 116, 2681–2690. [CrossRef]
20. Йегър, CL; Ashmun, RA; Уилямс, РК; Cardellichio, CB; Шапиро, LH; Виж, AT; Holmes, KV Човешката аминопептидаза N е рецептор за човешки коронавирус 229E. Nature 1992, 357, 420–422. [CrossRef]
21. Ву, К.; Li, W.; Peng, G.; Li, F. Кристална структура на NL63 респираторен коронавирусен рецептор-свързващ домейн в комплекс с неговия човешки рецептор. Proc. Natl. акад. Sci. САЩ 2009, 106, 19970–19974. [CrossRef]
22. Майерхолц, DK; Пърлман, С. Обикновената коронавирусна настинка предпазва ли от тежко SARS-CoV-2 заболяване? J. Clin. разследване. 2021, 131. [CrossRef] [PubMed]
23. Ringlander, J.; Мартнер, А.; Нилсон, С.; Westin, J.; Линд, М.; Hellstrand, K. Честота и тежест на Covid-19 при пациенти със и без предварително доказани инфекции с коронавируси на обикновена настинка. J. Инфектирайте. дис. 2021, 223, 1831–1832. [CrossRef]
24. Schnierle, BS Отговор на Ringlander et al. J. Инфектирайте. дис. 2021, 223, 1833. [CrossRef] [PubMed]
25. Берета, А.; Крейдж, М.; Зипето, Д. Дали кръстосано реактивният имунитет задейства имунопатогенезата на COVID-19? Преден. Immunol. 2020, 11, 2695. [CrossRef] [PubMed]
26. Creech, CB; Walker, SC; Samuels, RJ SARS-CoV-2 ваксини. JAMA 2021, 325, 1318–1320. [CrossRef]
27. Тао, К.; Tzou, PL; Nouhin, J.; Гупта, РК; де Оливейра, Т.; Kosakovsky Pond, SL; Фера, Д.; Shafer, RW Биологичното и клиничното значение на възникващите варианти на SARS-CoV-2. Нац. преп. Женет. 2021, 22, 757–773. [CrossRef]
28. Нгуен, Л.-Т.; Schmidt, HA; von Haeseler, A.; Minh, BQ IQ-TREE: Бърз и ефективен стохастичен алгоритъм за оценка на филогениите с максимална вероятност. Mol. Biol. Еволюция 2015, 32, 268–274. [CrossRef]
29. Хоанг, DT; Черномор, О.; von Haeseler, A.; Мин, BQ; Vinh, LS UFBoot2: Подобряване на ултрабързото приближение на Bootstrap. Mol. Biol. Еволюция 2018, 35, 518–522. [CrossRef]
30. Каляанамурти, С.; Мин, BQ; Wong, TKF; von Haeseler, A.; Jermiin, LS ModelFinder: Бърз избор на модел за точни филогенетични оценки. Нац. Методи 2017, 14, 587–589. [CrossRef]
31. Като, К.; Standley, DM MAFFT Софтуер за подравняване на множество последователности Версия 7: Подобрения в производителността и използваемостта. Mol. Biol. Еволюция 2013, 30, 772–780. [CrossRef]
32. Генова, CD; Сампсън, А.; Скот, С.; Кантони, Д.; Майора-Нето, М.; Бентли, Е.; Mattiuzzo, G.; Райт, Е.; Дервени, М.; Олд, Б.; et al. Производство, титруване, неутрализиране, съхранение и лиофилизация на лентивирусни псевдотипове на тежък остър респираторен синдром Коронавирус 2 (SARS-CoV-2). Био-протокол 2021, 11, e4236. [CrossRef]
33. Ферара, Ф.; Temperton, N. Анализи за неутрализиране на псевдотип: от лабораторна пейка до анализ на данни. Методи Protoc. 2018, 1, 8. [CrossRef]
34. Liu, C.; Гин, ХМ; Dejnirattisai, W.; Супаса, П.; Wang, B.; Tuekprakhon, A.; Nutalai, R.; Джоу, Д.; Менцер, AJ; Zhao, Y.; et al. Намалена неутрализация на SARS-CoV-2 B.1.617 от ваксина и реконвалесцентен серум. Cell 2021, 184, 4220–4236.e13. [CrossRef]
35. Шен, X.; Танг, Х.; Pajon, R.; Smith, G.; Glenn, GM; Shi, W.; Корбер, Б.; Montefiori, DC Неутрализиране на SARS-CoV-2 варианти B.1.429 и B.1.351. Н. англ. J. Med. 2021, 384, 2352–2354. [CrossRef]
36. Шен, X.; Танг, Х.; McDanal, C.; Wagh, K.; Fischer, W.; Theiler, J.; Юн, Х.; Ли, Д.; Haynes, BF; Сандърс, KO; et al. SARS-CoV-2 Вариант B.1.1.7 е податлив на неутрализиращи антитела, предизвикани от предшествени спайк ваксини. Микроб клетъчен гостоприемник 2021, 29, 529–539. [CrossRef]
37. Willett, BJ; Grove, J.; MacLean, OA; Wilkie, C.; Де Лоренцо, Г.; Furnon, W.; Кантони, Д.; Скот, С.; Логан, Н.; Ашраф, С.; et al. SARS-CoV-2 Omicron е вариант на имунно спасение с променен път на навлизане в клетката. Нац. Microbiol. 2022, 7, 1161–1179. [CrossRef]
38. Сиракузано, Г.; Ruggiero, A.; Bisoffi, Z.; Piubelli, C.; Carbonare, LD; Валенти, МТ; Майора-Нето, М.; Temperton, N.; Лопалко, Л.; Zipeto, D. Различно затихване на отговора на антитялото и чувствителността към VOC при наивни и предишно инфектирани субекти на 15 седмици след ваксинация с BNT162b2. J. Превод. Med. 2022, 20, 22. [CrossRef]
39. Поляк, FP; Томас, SJ; Кичин, Н.; Absalon, J.; Gurtman, A.; Локхарт, С.; Perez, JL; Перес Марк, Г.; Moreira, ED; Zerbini, C.; et al. Безопасност и ефикасност на ваксината BNT162b2 MRNA Covid-19. Н. англ. J. Med. 2020, 383, 2603–2615. [CrossRef]
40. Баден, LR; El Sahly, HM; Essink, B.; Kotloff, K.; Frey, S.; Новак, Р.; Diemert, D.; Spector, SA; Rouphael, N.; Creech, CB; et al. Ефикасност и безопасност на ваксината MRNA-1273 SARS-CoV-2. Н. англ. J. Med. 2021, 384, 403–416. [CrossRef]
41. Емари, KRW; Голубчик, Т.; Алей, ПК; Ариани, CV; Angus, B.; Биби, С.; Blane, B.; Bonsall, D.; Cicconi, P.; Чарлтън, С.; et al. Ефикасност на ChAdOx1 NCoV-19 (AZD1222) ваксина срещу SARS-CoV-2 Вариант на загриженост 202012/01 (B.1.1.7): Проучвателен анализ на рандомизирано контролирано изпитване. Lancet 2021, 397, 1351–1362. [CrossRef]
42. Edridge, AWD; Kaczorowska, J.; Хосте, ACR; Bakker, M.; Клайн, М.; Loens, K.; Jebbink, MF; Matser, A.; Kinsella, CM; Руеда, П.; et al. Защитният имунитет срещу коронавирус е краткотраен. Нац. Med. 2020, 26, 1691–1693. [CrossRef] [PubMed]
43. Олдридж, RW; Lewer, D.; Beale, S.; Джонсън, AM; Замбон, М.; Хейуърд, AC; Fragaszy, EB Сезонност и имунитет към лабораторно потвърдени сезонни коронавируси (HCoV-NL63, HCoV-OC43 и HCoV-229E): Резултати от кохортно проучване на Flu Watch. Wellcome Open Res 2020, 5, 52. [CrossRef] [PubMed]
44. Джан, С.-Ф.; Tuo, J.-L.; Хуанг, X.-B.; Жу, X.; Zhang, D.-M.; Джоу, К.; Юан, Л.; Luo, H.-J.; Zheng, B.-J.; Юен, К.-Й.; et al. Епидемиологични характеристики на човешки коронавируси при пациенти със симптоми на респираторна инфекция и филогенетичен анализ на HCoV-OC43 по време на 2010-2015 в Гуанджоу. PLoS ONE 2018, 13, e0191789. [CrossRef] [PubMed]
45. Byington, CL; Ампофо, К.; Stockmann, C.; Адлер, Франция; Herbener, A.; Милър, Т.; Шенг, X.; Blaschke, AJ; Крисп, Р.; Pavia, AT Общностно наблюдение на респираторни вируси сред семействата в Юта По-добро идентифициране на микроби – Проучване за надлъжна вирусна епидемиология (BIG-LoVE). Clin. заразявам. дис. 2015, 61, 1217–1224. [CrossRef] [PubMed]
46. Wells, DA; Кантони, Д.; Майора-Нето, М.; Генова, CD; Сампсън, А.; Ферари, М.; Carnell, G.; Nadesalingam, A.; Smith, P.; Чан, А.; et al. Неутрализиране на сезонен коронавирус при хора и тежест на COVID-19. J. Med. Virol. 2022, 94, 4820–4829. [CrossRef]
47. Шруани, К.; Sharma, R.; Кришнан, М.; Джоунс, Т.; Майора-Нето, М.; Кантони, Д.; Темпертън, Ню Джърси; Добсън, SL; Субраманиам, К.; Макнамара, PS; et al. Откриване на серумни кръстосано реактивни антитела и реакция на паметта към SARS-CoV-2 в препандемични и пост-пост-COVID-19 реконвалесцентни проби. J. Инфектирайте. дис. 2021, 224, 1305–1315. [CrossRef]
48. Ng, KW; Faulkner, N.; Корниш, GH; Роза, А.; Харви, Р.; Хюсеин, С.; Ulferts, R.; Ърл, С.; Wrobel, AG; Бентън, DJ; et al. Съществуващ и de Novo хуморален имунитет към SARS-CoV-2 при хора. Наука 2020, 370, 1339–1343. [CrossRef]
49. Woudenberg, T.; Pelleau, S.; Анна, Ф.; Атия, М.; Donnadieu, F.; Gravet, A.; Lohmann, C.; Серафин, Х.; Guiheneuf, R.; Delamare, C.; et al. Хуморален имунитет към SARS-CoV-2 и сезонни коронавируси при деца и възрастни в Североизточна Франция. EBioMedicine 2021, 70, 103495. [CrossRef]
50. Tso, FY; Lidenge, SJ; Пеня, PB; Клег, АА; Ngowi, JR; Mwaiselage, J.; Нгаламика, О.; Джулиус, П.; Уест, JT; Wood, C. Високо разпространение на съществуваща серологична кръстосана реактивност срещу коронавирус на тежък остър респираторен синдром-2 (SARS-CoV-2) в Субсахарска Африка. Вътр. J. Инфектирайте. дис. 2021, 102, 577–583. [CrossRef]
51. Laing, ED; Стърлинг, SL; Ричард, SA; Phogat, S.; Samuels, EC; Епси, Ню Джърси; Ян, Л.; Морено, Н.; Coles, C.; Мехалко, Дж.; et al. Бетакоронавирусен мултиплекс микросферен имуноанализ открива ранна сероконверсия на SARS-CoV-2 и контролира съществуваща сезонна кръстосана реактивност на човешки коронавирусни антитела. medRxiv 2020. [CrossRef]
52. Ladner, JT; Henson, SN; Бойл, AS; Engelbrektson, AL; Fink, ZW; Rahee, F.; D'ambrozio, J.; Schaecher, KE; Стоун, М.; Донг, В.; et al. Епитопно-разрешено профилиране на отговора на SARS-CoV-2 антитела идентифицира кръстосана реактивност с ендемични човешки коронавируси. Cell Rep. Med. 2021, 2, 100189. [CrossRef]
53. Песен, Г.; Той, В.; Callaghan, S.; Anzanello, F.; Хуанг, Д.; Ricketts, J.; Торес, JL; Beutler, N.; Peng, L.; Варгас, С.; et al. Кръстосано реактивен серум и В-клетъчни отговори на паметта на спайк протеин при SARS-CoV-2 и ендемична коронавирусна инфекция. Нац. Общ. 2021, 12, 2938. [CrossRef]
54. Хикс, Дж.; Klumpp-Thomas, C.; Калиш, Х.; Shunmugavel, A.; Мехалко, Дж.; Denson, J.-P.; Snead, KR; Дрю, М.; Корбет, Канзас; Греъм, BS; et al. Серологична кръстосана реактивност на SARS-CoV-2 с ендемични и сезонни бетакоронавируси. J. Clin. Immunol. 2021, 41, 906–913. [CrossRef]
55. Грифони, А.; Weiskopf, D.; Ramirez, SI; Матеус, Дж.; Дан, JM; Moderbacher, CR; Rawlings, SA; Съдърланд, А.; Премкумар, Л.; Jadi, RS; et al. Цели на Т-клетъчните отговори на SARS-CoV-2 коронавирус при хора с COVID-19 заболяване и неизложени лица. Cell 2020, 181, 1489–1501.e15. [CrossRef]
56. Матеус, Й.; Грифони, А.; Тарке, А.; Сидни, Дж.; Ramirez, SI; Дан, JM; Бъргър, ZC; Rawlings, SA; Smith, DM; Филипс, Е.; et al. Селективни и кръстосано реактивни SARS-CoV-2 Т клетъчни епитопи при неекспонирани хора. Наука 2020, 370, 89–94. [CrossRef]
57. Секине, Т.; Perez-Potti, A.; Ривера-Балестерос, О.; Strålin, K.; Gorin, J.-B.; Olsson, A.; Llewellyn-Lacey, S.; Камал, Х.; Богданович, Г.; Muschiol, S.; et al. Стабилен Т-клетъчен имунитет при реконвалесцентни индивиди с асимптоматичен или лек COVID-19. Cell 2020, 183, 158–168.e14. [CrossRef]
58. Шулиен, И.; Kemming, J.; Оберхард, В.; Уайлд, К.; Seidel, LM; Killmer, S.; Сагар; Daul, F.; Салват Лаго, М.; Decker, A.; et al. Характеризиране на съществуващи и индуцирани SARS-CoV-2-специфични CD8+ Т клетки. Nat Med 2021, 27, 78–85. [CrossRef]
59. Рейнолдс, CJ; Swadling, L.; Gibbons, JM; Pade, C.; Дженсън, MP; Диниз, Мисури; Schmidt, NM; Бътлър, Дания; Амин, OE; Бейли, SNL; et al. Дискордантни неутрализиращи антитела и Т-клетъчни отговори при асимптоматична и лека SARS-CoV-2 инфекция. Sci. Immunol. 2020 г., 5, eabf3698. [CrossRef]
60. Лоу, JS; Vaqueirinho, D.; Меле, Ф.; Фолиерини, М.; Jerak, J.; Пероти, М.; Jarrossay, D.; Йович, С.; Perez, L.; Cacciatore, R.; et al. Клонален анализ на имунодоминиране и кръстосана реактивност на CD4 Т клетъчния отговор към SARS-CoV-2. Наука 2021, 372, 1336–1341. [CrossRef]
61. Echeverría, G.; Гевара, А.; Coloma, J.; Ruiz, AM; Васкес, ММ; Tejera, E.; de Waard, JH Предшестващ Т-клетъчен имунитет към SARS-CoV-2 в неекспонирани здрави контроли в Еквадор, както е открито с COVID-19 анализ на освобождаване на интерферон-гама. Вътр. J. Инфектирайте. дис. 2021, 105, 21–25. [CrossRef]
62. Постън, Д.; Weisblum, Y.; Wise, H.; Templeton, K.; Дженкс, С.; Hatziioannou, Т.; Bieniasz, P. Отсъствие на неутрализираща активност при тежък остър респираторен синдром Коронавирус 2 в препандемични серуми от лица със скорошна сезонна коронавирусна инфекция. Clin. заразявам. дис. 2020, 73, e1208–e1211. [CrossRef] [PubMed]
63. Аманат, Ф.; Тапа, М.; Лей, Т.; Ахмед, SMS; Аделсберг, окръг Колумбия; Carreño, JM; Strohmeier, S.; Schmitz, AJ; Зафар, С.; Джоу, JQ; et al. SARS-CoV-2 МРНК ваксинацията индуцира функционално различни антитела срещу NTD, RBD и S2. Cell 2021, 184, 3936–3948.e10. [CrossRef]
64. Angyal, A.; Longet, S.; Мур, SC; Payne, RP; Хардинг, А.; Типтън, Т.; Rongkard, P.; Али, М.; Херинг, LM; Meardon, N.; et al. Отговори на Т-клетки и антитела към първата доза ваксина BNT162b2 при предишно заразени и нелекуващи SARS-CoV-2-здравни работници в Обединеното кралство: Многоцентрово проспективно кохортно проучване. Lancet Microbe 2022, 3, e21–e31. [CrossRef] [PubMed]
65. Скели, DT; Хардинг, AC; Gilbert-Jaramillo, J.; Найт, ML; Longet, S.; Браун, А.; Адел, С.; Adland, E.; Браун, Х.; Типтън, Т.; et al. Две дози ваксинация срещу SARS-CoV-2 предизвикват силни имунни отговори на нововъзникващите опасни варианти на SARS-CoV-2. Нац. Общ. 2021, 12, 5061. [CrossRef] [PubMed]
66. Гробен, М.; ван дер Стратен, К.; Брауер, PJ; Brinkkemper, M.; Maisonnasse, P.; Dereuddre-Bosquet, N.; Appelman, B.; Lavell, AA; van Vught, LA; Бъргър, JA; et al. Кръстосано реактивни антитела след SARS-CoV-2 инфекция и ваксинация. eLife 2021, 10, e70330. [CrossRef]
67. Андерсън, ЕМ; Goodwin, EC; Верма, А.; Arevalo, CP; Болтън, MJ; Weirick, ME; Gouma, S.; McAllister, CM; Кристенсен, SR; Уивър, Дж.; et al. Сезонните човешки коронавирусни антитела се повишават при SARS-CoV-2 инфекция, но не са свързани със защита. Cell 2021, 184, 1858–1864.e10. [CrossRef]
68. Сермет-Гауделус, И.; Temmam, S.; Huon, C.; Behillil, S.; Гайдос, В.; Бигот, Т.; Луриер, Т.; Кретиен, Д.; Бакович, М.; Delaunay Moisan, A.; et al. Предишна инфекция от сезонни коронавируси, оценена чрез серология, не предотвратява SARS-CoV-2 инфекция и заболяване при деца, Франция, април до юни 2020 г. Eurosurveillance 2021, 26, 2001782. [CrossRef]
69. Гомбар, С.; Бергквист, Т.; Пеявер, В.; Хамарлунд, NE; Муругесан, К.; Mooney, S.; Шах, Н.; Пински, бакалавър; Banaei, N. SARS CoV-2 инфекция и COVID-19 тежест при лица с предишна сезонна коронавирусна инфекция. диагностика Microbiol. заразявам. дис. 2021, 100, 115338. [CrossRef]
70. Qian, Z.; Оу, X.; Гоес, LGB; Osborne, C.; Кастано, А.; Холмс, KV; Dominguez, SR Идентифициране на рецептор-свързващия домейн на шиповия гликопротеин на човешки бетакоронавирус HKU1. J. Virol. 2015, 89, 8816–8827. [CrossRef]
71. Оу, X.; Guan, H.; Qin, B.; Mu, Z.; Wojdyla, JA; Уанг, М.; Домингес, SR; Qian, Z.; Cui, S. Кристална структура на рецепторно-свързващия домен на шиповия гликопротеин на човешки бетакоронавирус HKU1. Nat Commun 2017, 8, 15216. [CrossRef]
72. Vogel, AB; Каневски, И.; Che, Y.; Суонсън, Калифорния; Муик, А.; Vormehr, М.; Кранц, LM; Walzer, KC; Хайн, С.; Гюлер, А.; et al. BNT162b ваксините предпазват резус макаците от SARS-CoV-2. Nature 2021, 592, 283–289. [CrossRef]
73. Джаксън, Луизиана; Андерсън, EJ; Rouphael, NG; Робъртс, PC; Makhene, M.; Coler, RN; Маккълоу, MP; Chappell, JD; Denison, MR; Стивънс, LJ; et al. MRNA ваксина срещу SARS-CoV-2—Предварителен доклад. Н. англ. J. Med. 2020, 383, 1920–1931. [CrossRef]
74. Лоуренц, Дж.; Xie, Q.; Zech, F.; Weil, T.; Seidel, A.; Krnavek, D.; van der Hoek, L.; Münch, J.; Мюлер, JA; Kirchhoff, F. Тежък остър респираторен синдром Коронавирус 2 Ваксинирането повишава неутрализиращата активност срещу сезонните човешки коронавируси. Clin. заразявам. дис. 2022, 75, e653–e661. [CrossRef]
75. Simula, ER; Манка, MA; Jasemi, S.; Uzzau, S.; Рубино, С.; Manchia, P.; Бити, А.; Палермо, М.; Sechi, LA HCoV-NL63 и SARS-CoV-2 споделят разпознати епитопи от хуморалния отговор в серуми на хора, събрани преди и по време на CoV-2 пандемия. Microorganisms 2020, 8, 1993. [CrossRef]
76. Чан, KH; Cheng, VCC; Уау, PCY; Lau, SKP; Poon, LLM; Guan, Y.; Seto, WH; Юен, Кентъки; Peiris, JSM Серологични отговори при пациенти с коронавирусна инфекция с тежък остър респираторен синдром и кръстосана реактивност с човешки коронавируси 229E, OC43 и NL63. Clin. Ваксина Имунол. 2005, 12, 1317–1321. [CrossRef]
77. Лин, Х.-Х.; Фън, Ю.; Ту, X.; Джао, X.; Hsieh, C.-H.; Грифин, Л.; Юноп, М.; Zhang, C. Характеризиране на шиповидния протеин на човешки коронавирус NL63 при рецепторно свързване и навлизане на псевдотип на вируса. Virus Res. 2011, 160, 283–293. [CrossRef]
78. Хайнц, FX; Stiasny, K. Отличителни характеристики на настоящите ваксини срещу COVID-19: известни и неизвестни за представянето на антигена и начините на действие. npj Ваксини 2021, 6, 1–13. [CrossRef]
79. Мартинес-Флорес, Д.; Зепеда-Сервантес, Ж.; Круз-Ресендиз, А.; Aguirre-Sampieri, S.; Sampieri, A.; Vaca, L. SARS-CoV-2 ваксини, базирани на шипов гликопротеин и последици от нови вирусни варианти. Преден. Immunol. 2021, 12. [CrossRef]
80. Долгин, Е. Пан-коронавирусната ваксина се оформя. Нац. Rev. Drug Discov. 2022, 21, 324–326. [CrossRef]
