Съществуващият хуморален имунитет към човешки коронавируси на обикновена настинка оказва отрицателно въздействие върху защитния отговор на SARS CoV-2 антитела

Графичен абстракт

РЕЗЮМЕ

Инфекцията със SARS-CoV-2 причинява различни резултати, вариращи от асимптоматична инфекция до респираторен дистрес и смърт. Основен неразрешен въпрос е дали предшестващият имунитет към ендемични коронавируси на обикновена настинка при хора (hCCCoVs) влияе върху чувствителността към инфекция със SARS-CoV-2 или върху имунитета след инфекция и ваксинация. Затова анализирахме проби от едни и същи индивиди преди и след SARS-CoV-2 инфекция или ваксинация. Открихме как нивата на антителата се повишават след излагане на SARS-CoV-2, демонстрирайки кръстосана реактивност. Проучване случай-контрол обаче показва, че изходните нива на hCCCoV антитела не са свързани със защита срещу SARS-CoV-2 инфекция. По-скоро по-високите величини на съществуващи бетакоронавирусни антитела корелират с повече SARS-CoV-2 антитела след инфекция, показател за по-голяма тежест на заболяването. Освен това, имунизацията с шипови протеини на hCCCoV преди имунизацията срещу SARS-CoV-2 възпрепятства генерирането на SARS-CoV-2-неутрализиращи антитела при мишки. Заедно тези данни предполагат, че съществуващите hCCCoV антитела възпрепятстват базирания на SARS-CoV-2 антитяло имунитет след инфекция и дават представа как съществуващият коронавирусен имунитет влияе върху SARS-CoV-2 инфекцията, което е критично разглеждане на нововъзникващите варианти.

cistanche tubulosa - подобряват имунната система

ВЪВЕДЕНИЕ

Коронавирус 2 на тежък остър респираторен синдром (SARS-CoV-2) предизвиква силно променливо заболяване, вариращо от много леки или никакви симптоми до тежък респираторен дистрес и смърт. Някои съпътстващи заболявания допринасят за различните резултати; тези фактори обаче не отчитат цялата хетерогенност, наблюдавана между заразените индивиди. Основен неразрешен въпрос е дали податливостта към инфекция със SARS-CoV-2 и тежестта на заболяването след инфекцията се влияят от имунитета към коронавирусите на обикновена настинка при хора (hCCCoVs), които са циркулирали преди пандемията от SARS-CoV-2. Четири hCCCoV, които са разпространени в световен мащаб, са ендемични при хората от десетилетия и обикновено предизвикват леко заболяване на горните дихателни пътища и представляват 30% от „обикновените настинки“ (Forni et al., 2017). HKU1 и OC43 са бетакоронавируси, както и SARS-CoV-2, които са еволюционно различни от алфакоронавирусите, 229E и NL63. Въпреки драматичните разлики в тежестта на заболяването, предизвикано от вирусите, SARS-CoV-2 и ендемичните hCCCoV споделят 30% хомология в шиповите протеини (Hicks et al., 2021). Проучванията идентифицират кръстосано реактивни антитела, които свързват както SARS-CoV-2, така и hCCCoV (Ladner et al., 2020; Ng et al., 2020; Wec et al., 2020). Не е ясно обаче как съществуващите hCCCoV антитела влияят на имунния отговор срещу SARS-CoV-2 инфекция (Sealy and Hurwitz, 2021). Предишни инфекции с hCCCoV биха могли да увеличат имунитета срещу SARS-CoV-2, ако hCCCoV антителата са достатъчно кръстосано реактивни със SARS-CoV-2, за да бъдат индуцирани чрез имунологично припомняне или „обратно подсилване“ и поддържат вирусния клирънс ( Fonville и др., 2014). Обратно, съществуващият хуморален имунитет срещу hCCCoV може да попречи на генерирането на ефективни SARS-CoV-2-специфични антитела чрез разширяване на кръстосано реактивни антитела, които не неутрализират SARS-CoV-2. Освен това, съществуващият hCCCoV имунитет може да влоши заболяването чрез улесняване на навлизането на вируса в клетки, експресиращи Fc рецептор (FcR), за да причини зависимо от антитялото усилване на заболяването (Arvin et al., 2020; Iwasaki and Yang, 2020). Тъй като имунитетът срещу hCCCoV може да повлияе на изхода от инфекцията със SARS-CoV-2 по няколко начина, от решаващо значение е да се установи влиянието на съществуващите антитела срещу hCCCoV върху имунитета към инфекцията със SARS-CoV-2. Доклади, изследващи дали антителата, специфични за hCCCoVs, се повишават след инфекция със SARS-CoV-2, дават противоречиви резултати. Някои данни предполагат, че антителата, специфични за hCCCoVs, не са били усилени след инфекция със SARS-CoV-2 (Dugas et al., 2021a, 2021b; Loos et al., 2020), докато други съобщават за усилване само при OC{{58} }специфични антитела (Anderson et al., 2021; Guo et al., 2021; Nguyen-Contant et al., 2020; Pre´vost et al., 2020). Допълнителни проучвания установяват повишаване както на HKU1, така и на OC43 антитела (Aydillo et al., 2021; Cohen et al., 2021; Gouma et al., 2021; Westerhuis et al., 2021) или на антитела, специфични за всичките четири hCCCoV след SARS -CoV-2 инфекция (Ng et al., 2020; Shrock et al., 2020). И все пак, други доклади изненадващо откриха тласък предимно в антителата, специфични за алфа коронавирусите (Becker et al., 2021; Ortega et al., 2021). Основен фактор, допринасящ за тези несъответствия, е, че предишни проучвания не са изследвали нивото на HCV антитела при един и същи индивид преди и след SARS-CoV-2 инфекция.

cistanche tubulosa - подобряват имунната система

Оценката дали предишният имунитет срещу hCCCoV влияе върху чувствителността към заболяването SARS-CoV-2 също даде противоречиви резултати (Sealy and Hurwitz, 2021). Докато някои проучвания съобщават, че нивата на HCV антитела не корелират с тежестта на заболяването или вероятността от заразяване (Anderson et al., 2021; Gombar et al., 2021; Loos et al., 2020), други стигат до заключението, че по-високите нива на Антителата срещу hCCCoV се свързват с по-леко заболяване (Becker et al., 2021; Dugas et al., 2021a, 2021b; Henss et al., 2021; Ortega et al., 2021; Sagar et al., 2021; Shrock et al., 2020) или с по-кратка продължителност на симптомите (Gouma et al., 2021). Обратно, други откриват по-високи нива на hCCCoV антитела, свързани с повишена тежест на заболяването SARS-CoV-2 (Aydillo et al., 2021; Guo et al., 2021; Pre´vost et al., 2020; Westerhuis et al. , 2021). Здравният статус варира значително в кохортите, тествани в предишните проучвания, и повечето от тези проучвания не тестват проби от един и същи индивид преди и след инфекция със SARS-CoV-2, което вероятно допринася за несъответствието в заключенията. По този начин влиянието на съществуващия имунитет срещу hCCCoV върху чувствителността към инфекция със SARS-CoV-2 остава нерешено. Тук измерихме имуноглобин (Ig) G, IgM и IgA антитела в проби, получени от един и същи индивид преди и след PCR-потвърдена SARS-CoV-2 инфекция. Наблюдавахме значително увеличение на бетакоронавирусните IgG антитела; високите нива на HCV антитела обаче не са свързани със защитата срещу SARS-CoV-2 инфекция. Обратно, по-голямото увеличение на антителата срещу hCCCoV корелира с по-високите нива на антитела на SARS-CoV-2 след инфекция, което е свързано с повишена тежест на заболяването. Освен това, мишки, имунизирани с hCCCoV шипове протеини преди SARS-CoV-2 шипове, показват дълбоко понижение на SARS-CoV-2-неутрализиращи антитела в сравнение с мишки, имунизирани само с SARS-CoV-2 шипове . Като цяло тези данни предполагат, че съществуващите hCCCoV IgG антитела могат да попречат на имунния отговор към SARS-CoV-2.

cistanche tubulosa - подобряват имунната система

Щракнете тук, за да видите продуктите Cistanche Enhance Imunity

【Попитайте за повече】 Имейл:cindy.xue@wecistanche.com / Whats App: 0086 18599088692 / Wechat: 18599088692

РЕЗУЛТАТИ

Често срещаните изотипове на hCCCoV антитела са свързани с възрастта и директния контакт с пациента

Създадохме проспективна, надлъжна кохорта (проучване St. Jude Tracking of Viral and Host Factors Associated with COVID-19, SJTRC) от служители на St. Jude, които предоставиха базова кръвна проба при записване и се подложиха на седмичен скрининг с назален тампон за SARS -CoV-2 инфекция чрез PCR (Таблица S1). Индивидите, които са дали положителен тест по време на изследването, са предоставили проби на два пъти след заразяването. Освен това участниците, които не са се заразили, са дали проби след ваксинация. Този дизайн позволява анализ на проби от едни и същи индивиди, взети преди и след инфекция или ваксинация със SARS-CoV-2. Важно е, че седмичният скрининг на назален тампон идентифицира асимптоматични инфекции през целия период на изследването. За да оценим имунитета преди инфекция със SARS-CoV-2, ние анализирахме 1202 изходни проби за антитела, специфични за пиковите протеини на OC43, HKU1, 229E и NL63 чрез ELISA. За да се контролира променливостта от плоча до плоча, едни и същи положителни контролни проби бяха тествани на всяка плоча и беше представена нормализираната оптична плътност (OD) за всяка проба. Въпреки че нивата на антителата варират при отделните индивиди, IgG антитела, специфични за всичките четири hCCCoV шипове протеини, са идентифицирани в почти всички участници (Фигури 1A и 1D). HCV IgM антителата са по-малко разпространени от IgG и IgA, като IgA антителата показват най-голяма вариабилност (Фигури 1A-1D). Интересното е, че има по-силни корелации между изотиповете на антитялото, отколкото специфичността към определен вирус (Фигура 1E). Например, индивиди с високи нива на HKU1 IgM е по-вероятно да имат IgM антитела, специфични за другите три hCCCoVs, отколкото за HKU1 IgG и IgA. Освен това, индивиди с високи нива на HKU1 IgG не е задължително да имат високи нива на HKU1 IgA и IgM. Заедно тези данни показват, че почти всеки индивид е имал антитела, специфични за всичките четири hCCCoV преди инфекция или ваксинация със SARS CoV-2. Освен това, по-силните корелации с изотипа на антитялото в сравнение с типа на вируса предполагат, че има кръстосана реактивност между hCCCoV-специфичните антитела, с по-висока степен на промискуитет в IgM отговора, последван от IgA, след това IgG, в съответствие с предишни проучвания (Becker et al., 2021; Постън и др., 2021).

След това проверихме дали нивото на hCCCoV антитела в началото корелира с възрастта, пола, расата или директния контакт с пациента. Сравнихме нивата на антитела при индивиди над и под средната възраст към момента на записване, която беше 43-годишна възраст (Таблица S1). Установихме, че по-възрастните индивиди имат значително по-високи нива на IgA срещу HKU1, 229E и NL63 (Фигура 2А). Обратно, по-младите индивиди са имали значително по-високи нива на IgM, реагиращи с четирите отличия в сравнение с по-възрастните индивиди. Установихме също, че женските имат по-високи нива на всичките четири hCCCoV IgM антитела и по-високи OC43 IgA антитела в сравнение с мъжете (Фигура S1A). Освен това нивата на IgG и IgA антитела се различават в различните расови/етнически групи в приблизително 10% от анализите (Фигура S1B). Тъй като участниците в проучването са служители в педиатрична болница и взаимодействията с деца могат да увеличат експозицията на hCCCoV, ние оценихме такта. Индивидите с директен контакт с пациенти са имали по-високи нива на IgM антитела, специфични за всичките четири отличия, както и OC43 IgA (Фигура 2B). Заедно тези данни показват, че в кохортата на SJTRC по-младите участнички от женски пол с директен контакт с пациенти са по-склонни да имат повишени нива на hCCCoV IgM. Тъй като кохортата на SJTRC не включва индивиди на възраст под 20 години, ние също анализирахме нивата на антитела в проби, събрани от предишно проучване, кохортата FLU09, което включва по-широк възрастов диапазон от участници. Подобно на предишни доклади (Selva et al., 2021), открихме по-високи нива на повечето hCCCoV IgG антитела и всички IgA антитела при по-възрастни индивиди в сравнение с по-млади индивиди (фигури S2A–S2I). Неочаквано нивата на IgM антитела за повечето от отличията бяха ниски при млади индивиди, достигнаха своя връх около 20-годишна възраст и след това спаднаха с възрастта (фигури S2B и S2E). Затова проучихме дали има връзка между нивата на антителата и възрастта при индивиди 0–14 (Фигури S2J–S2L) или 17–54 години (Фигури S2M–S2O). Установихме, че повечето нива на IgG и IgA антитела се увеличават с възрастта през по-младите години (фигури S2G и S2I) и след това остават стабилни (фигури S2M и S2O). Обратно, не е имало значителна връзка между IgM и възрастта в по-младата група (Фигура S2K), но е установен значителен спад на IgM с възрастта за участниците на възраст 17–54 години (Фигура S2N). Спадът на IgM във възрастовата група 17–54 е в съответствие с кохортата на SJTRC, където открихме по-високи нива на hCCCoV IgM при по-млади индивиди (20–43 години) в сравнение с по-възрастните участници (Фигура 2А). Тези данни показват, че IgG и IgA hCCCoV антителата започват да се натрупват много рано в живота. Интересно е, че нивата на IgM са склонни да достигнат пик между 10-30-годишна възраст, вместо да намаляват линейно с възрастта. Тъй като по-младите индивиди са по-склонни да бъдат наскоро изложени на наличие и биха имали по-висок дял на наивни IgM+ B клетки в сравнение с по-възрастните индивиди, очаквахме да видим по-високи нива на IgM при по-млади индивиди. Като цяло, тези данни показват широката степен на хетерогенност в hCCCoV имунитета между отделните индивиди и демонстрират, че повечето индивиди имат антитела, специфични за всичките четири hCCCoV от много ранна възраст.

Фигура 1. Голяма вариация в изходните нива на hCCCoV антитела

HCV антителата се повишават след инфекция със SARS-CoV-2

While studies identified cross-reactive antibodies that bind both SARS-CoV-2 and hCCCoVs (Ladner et al., 2020; Ng et al., 2020; Wec et al., 2020), there is significant controversy regarding whether hCCCoV antibodies are boosted after SARS-CoV-2 infection (Anderson et al., 2021; Aydillo et al., 2021; Becker et al., 2021; Dugas et al., 2021a, 2021b; Gouma et al., 2021; Guo et al., 2021; Loos et al., 2020; Ng et al., 2020; Nguyen-Contant et al., 2020; Ortega et al., 2021; Pre´ vost et al., 2020; Shrock et al., 2020; Westerhuis et al., 2021). If pre-existing hCCCoV-specific antibodies cross-react to SARS-CoV-2, the levels of hCCCoV-specific antibodies would increase following SARS-CoV-2 infection. Alternatively, if antibodies specific for hCCCoVs do not cross-react to SARS-CoV-2, the levels of hCCCoV antibodies would not change after infection. We analyzed samples taken before and at two-time points after confirmed SARS CoV-2 infection. The first sample after infection was collected during the acute phase (1–20 days) (Figure 3A), and a subsequent sample was taken during the convalescent phase (>20 дни) (Фигура 3B). Интересно е, че няколко индивида показват намалени нива на hCCCoV антитела малко след инфекцията със SARS-CoV-2 спрямо изходното ниво, което е показано с отрицателна процентна промяна на изходното ниво (Фигури 3C–3E и S3A–S3C; Таблица S2). Това намаление е най-очевидно в проби, взети през първите 20 дни след заразяването. Намаляването на hCCCoV антителата малко след инфекцията със SARS-CoV-2 подчертава предупреждението да не се анализират hCCCoV антитела в двойки проби, събрани преди инфекцията със SARS-CoV-2. Подобно на асоциациите преди инфекцията, индивиди, показващи увеличение на IgM антитела към един подтип на hCCCoVs, обикновено показват повишения на IgM, реактивни към всички hCCCoVs (Фигури 3A и 3B). Обратно, IgA антителата, специфични за двата бетакоронавируса, обикновено се повишават едновременно. Интересно е, че нивата на HKU1 IgG се повишават най-много след инфекция със SARS-CoV-2 в сравнение с другите hCCCoV IgG антитела, докато OC43 IgA показва най-голямо увеличение на IgA антителата (Фигури 3A и 3B; Таблица S2). Като цяло, HKU1 и OC43 IgG и IgA антителата показват най-високото и най-последователно увеличение спрямо изходните нива в сравнение с антителата, специфични за алфакоронавирусите (Фигури 3A–3H; Таблица S2), което е в съответствие с по-голямата хомология сред бетакоронавирусите. Важно е, че нивата на hCCCoV антитела не се променят при индивиди, заразени с грипния вирус (фигури S3D–S3F), което показва, че увеличението на hCCCoV антитела отразява по-скоро кръстосана реактивност с SARS-CoV-2 инфекция, отколкото неспецифично последствие от инфекцията .

Фигура 2. Нивата на hCCCoV IgM корелират обратно с възрастта и са по-високи при лица с директен контакт с пациенти

Фигура 3. Антителата, специфични за OC43 и HKU1, се увеличават след инфекция със SARS-CoV-2

Увеличаването на антителата срещу hCCCoV след инфекция със SARS-CoV-2 може да се дължи на активиране на съществуващи В-клетки на паметта, които са били генерирани след предишна инфекция с hCCCoV. Като алтернатива, повишените нива на hCCCoV антитела след инфекция със SARS-CoV2 може да се дължат на генерирането на нови антитела, които реагират кръстосано на hCCCoV в отговор на SARS-CoV-2. За да различим тези възможности, ние измерихме нивата на антитела в проби, събрани по различно време след диагностицирането на SARS-CoV-2. Ние разсъждавахме, че увеличаването на hCCCoV антителата, дължащо се на усилване на вече съществуващи В-клетки на паметта, ще бъде открито бързо след диагностицирането, докато увеличението на hCCCoV антителата в резултат на новогенерирани антитела ще бъде очевидно по-късно. Забележително е, че нивата на HKU1 IgG бързо се повишават при няколко индивида през първите 5 дни след диагностицирането на SARS-CoV-2 (Фигури 3C и 3F), а нивата на OC43 и HKU1 IgA се повишават в рамките на 10 дни при над 50% от индивидите (Фигури 3E и 3H). Ранното нарастване на бетакоронавирусните hCCCoV IgG и IgA антитела предполага, че инфекцията със SARS-CoV-2 активира съществуващи В-клетки на паметта, за да стимулира антителата, генерирани по време на предишни hCCCoV инфекции. Освен това, ако увеличението на антителата срещу hCCCoV се дължи на новосъздадени антитела в отговор на инфекция със SARS-CoV-2, тогава бихме очаквали тези антитела също да бъдат специфични за SARS-CoV-2-. Затова проучихме дали индивиди с високи нива на HKU1 IgG антитела в рамките на 5 дни след диагностицирането също са имали антитела, които разпознават пика на SARS-CoV-2 или рецепторния свързващ домейн (RBD) на пика. Въпреки че няколко индивида са имали положителни нива на пика на SARS CoV-2 и RBD IgG в рамките на 5 дни след диагностицирането (Фигури 3I–3L и S4), няма корелация между нивото на пика на SARS-CoV-2 или RBD IgG и HKU1 IgG (Фигури 3I и 3J) или корелация между пика на SARS-CoV-2 или RBD IgG и повишаването на HKU1 IgG (Фигури 3K и 3L). Интересното е, че IgM антитела, специфични за SARS-CoV-2 протеините, обикновено не се наблюдават преди IgG или IgA (Фигура S4), което би се очаквало след излагане на нов вирус или ваксина (Li et al., 2014; Wolf et al., 2011). По този начин отговорът на антитялото към SARS-CoV-2 показва модел, подобен на този, който би се очаквал след усилване на отговора на паметта. Заедно тези данни са в съответствие с идеята, че SARS-CoV-2 активира вече съществуващи В-клетки на паметта, за да стимулира антителата, които са били генерирани след предишна HCV инфекция. Антителата срещу hCCCoV, открити в по-късни времеви точки, вероятно са комбинация от подсилени, съществуващи антитела и новогенерирани антитела, които реагират кръстосано на hCCCoV. Ако съществуващите антитела разпознават епитопите на SARS-CoV-2, те биха могли да намалят тежестта на инфекцията чрез насърчаване на вирусния клирънс. Като алтернатива, ако антителата не свързват SARS-CoV-2 с достатъчна авидност, тези антитела могат да забавят генерирането на ефективни антитела, специфични за SARS-CoV-2, като се конкурират с наивните В клетки за антиген и цитокини. Фактът, че индивиди с ранно повишаване или високи нива на hCCCoV антитела в рамките на 5 дни след диагностицирането на SARS-CoV-2 не са имали SARS-CoV-2-специфични антитела по това време, предполага, че hCCCoV антителата не свързват SARS-CoV-2 с достатъчна авидност, за да бъдат открити чрез ELISA.

cistanche tubulosa - подобряват имунната система

HCV антителата не оказват влияние върху вероятността от заразяване със SARS-CoV-2

Тъй като hCCCoV-специфичните антитела реагират кръстосано със SARS-CoV- 2, както се вижда от ранното увеличение след инфекция и предишни проучвания (Ladner et al., 2020; Ng et al., 2020), ние извършихме голям случай -контролно проучване, за да се тества дали съществуващите hCCCoV IgG, IgM и IgA антитела са различни между индивидите, които са се заразили по време на изследването, в сравнение с индивидите, които са останали отрицателни. Важно е да се отбележи, че всички индивиди са били подложени на седмичен скрининг на назален тампон, което ни позволи да идентифицираме асимптоматични инфекции и да потвърдим всички инфекции със SARS-CoV-2 чрез PCR. Ние оценихме изходните hCCCoV антитела при 121 индивида, които впоследствие станаха положителни по време на проучването, и ги сравнихме с изходните проби от 1081 индивида, които останаха неинфектирани. Въпреки че hCCCoV антителата проявяват достатъчна кръстосана реактивност със SARS-CoV-2, за да се увеличат след инфекция, изходните нива на hCCCoV антитела не се различават между индивидите, които са се заразили, в сравнение с тези, които са останали SARS-CoV-2 отрицателни по време на периода на изследване (Фигура 4; Таблица S3). Тези данни предполагат, че предишна инфекция с hCCCoVs не предпазва от инфекция със SARS CoV-2, което е в съответствие с неспособността на hCCCoV-специфичните антитела да неутрализират SARS-CoV-2 (Aguilar-Bretones et al. , 2021 г.; Легрос и др., 2021 г.; Постън и др., 2021 г.).

Фигура 4. Изходните нива на HCV антитела не корелират със защитата от SARS-CoV-2 инфекция

Изходните HCV антитела не осигуряват защитен имунитет срещу SARS-CoV-2 инфекция

Докато изходните нива на hCCCoV антитела не се различават между участниците, които са се заразили, в сравнение с тези, които са останали SARS-CoV-2 отрицателни, hCCCoV антителата могат да повлияят на тежестта или продължителността на симптомите. Следователно, ние оценихме дали има връзка между тежестта на заболяването и изходните нива на HCV антитела. Заразените индивиди получиха оценка от 1 до 5 въз основа на априорна ординална скала, както следва: (1) безсимптомно, (2) леко-умерено, (3) умерено-тежко заболяване, (4) тежко заболяване и (5) критично заболяване. Тази скала ни позволи да разграничим наистина асимптоматични, минимално симптоматични и по-тежки симптоматични индивиди. Повечето участници в тази кохорта имаха леки-умерени и умерено-тежки оценки на тежест (скорове на тежест 2 до 3). Тъй като само няколко индивида бяха асимптоматични, тежки или критични, ние сравнихме изходните hCCCoV антитела между индивиди, които бяха асимптоматични или имаха леко заболяване (скор на тежест от 1 до 2) с индивиди, които са преживели умерено, тежко или критично заболяване (скор на тежест 3–5). Не открихме значителна разлика между изходните нива на hCCCoV антитела и тежестта на заболяването при сравняване на тези две групи (Фигури 5A и 5B). Освен това, продължителността на симптома не корелира с изходните нива на hCCCoV антитела (Фигури 5A и S5). Тези данни предполагат, че изходните нива на HCV антитела не осигуряват значителна защита срещу SARS-CoV-2 инфекция. Въпреки това, тъй като имаше малко случаи на тежък COVID-19, изискващ хоспитализация или критично заболяване при включените участници, способността ни да идентифицираме предиктори за тези състояния е ограничена.

Фигура 5. Изходните нива на HCV антитела не корелират с тежестта на заболяването след SARS-CoV-2 инфекция

Съществуващите HCV антитела влияят върху отговора на SARS-CoV-2 антитела

Тъй като кохортата на SJTRC се състои предимно от индивиди с лека до умерена тежест на заболяването и само четирима души са имали тежко или критично заболяване, въздействието на HCV антителата върху много тежки случаи може да не е очевидно в тази кохорта. Много проучвания съобщават, че нивото на пик на SARS-CoV-2 или RBD IgG или IgA след инфекция корелира с тежестта на заболяването (Aguilar-Bretones et al., 2021; Becker et al., 2021; Doban˜o et al. , 2021; Garcia-Beltran et al., 2021; Guthmiller et al., 2021; Legros et al., 2021; Ortega et al., 2021; Shrock et al., 2020). Това може да се дължи на факта, че индивиди с по-тежко заболяване вероятно имат повече вирусна репликация и следователно по-голяма експозиция на антиген. По този начин отговорът на антитялото след инфекция може да осигури средство за допълнително стратифициране на тежестта на заболяването в рамките на групите, независимо от самоотчитаните симптоми. Затова проучихме дали отговорът на антителата 16–40 дни след инфекцията със SARS CoV-2 корелира с тежестта на заболяването в кохортата на SJTRC, в която повечето участници са имали лека до умерена тежест на заболяването. Важно е, че никой от заразените лица не е получил ваксина преди събирането на проби, използвани за това сравнение или други сравнения, докладвани тук. Подобно на други проучвания, нивото на IgG, специфично за пик на SARS-CoV-2, RBD и N протеин, значително корелира с повишените резултати за тежест на заболяването (Фигури 6A и S6). По-високите пикове и RBD IgM и пиковите нива на IgA също корелират с по-тежко заболяване. Тези данни показват, че въпреки че повечето участници са имали леко умерено заболяване, нивата на SARS-CoV-2-специфични IgG и IgM корелират с тежестта. Следователно, ние сравнихме изходните нива на hCCCoV антитела с нивата на SARS-CoV-2 антитела след инфекция, за да оценим допълнително връзката на изходните hCCCoVs и отчетлива корелация на тежестта на заболяването.

Фигура 6. Съществуващите нива на HCV антитела са свързани с големината на отговора на антитялото SARS-CoV-2 след инфекция, но не и ваксинация

Интересно е, че по-високите нива на OC43 IgG преди инфекцията корелират с повишен SARS-CoV-2 IgG след инфекция (Фигура 6B), което повишава възможността високото изходно ниво на OC43 IgG да е свързано с по-тежко заболяване. За да проучим допълнително въздействието на имунитета на hCCCoV върху имунния отговор на SARS-CoV-2, тествахме дали степента на антитялото на hCCCoV се повишава или намалява след инфекция със SARS-CoV-2, повлияна от SARS-CoV{{ 10}} нива на антитела. Количеството, което нивата на hCCCoV антитела се увеличават в първите дни след инфекцията със SARS-CoV-2, е показателно за степента, в която В-клетките на паметта се активират да произвеждат антитела. По този начин изчислихме процентната промяна на HCV антитялото в изходната проба спрямо пробата, взета в рамките на първите 15 дни след диагностицирането. Увеличаването на нивата на HCV антитела в тази времева рамка би отразявало степента на активиране на В-клетките на паметта. Сравнихме тази промяна с нивата на антителата срещу SARS-CoV-2 16–40 дни след инфекцията, тъй като тези нива корелираха с тежестта на заболяването в нашата кохорта, както и с няколко други проучвания. Интересно е, че по-голямото увеличение на бетакоронавирусните IgG и IgA се свързва с по-високи нива на SARS-CoV-2 IgG и IgM антитела след инфекция (Фигура 6C). Тъй като повишените нива на SARS-CoV-2 IgG и IgM са свързани с по-голяма тежест на заболяването, тези данни повишават възможността ранното повишаване (1–15 дни след инфекцията) на антителата да е свързано с по-висока тежест на заболяването. Алтернативно, връзката между повишаването на нивата на hCCCoV антитела с по-високи SARS-CoV-2-индуцирани антитела може да се дължи на новогенерирани антитела в отговор на SARS-CoV-2 инфекция, които реагират кръстосано с hCCCoVs. Въпреки това анализът на проби, взети през първите 5 дни от диагностицирането на SARS-CoV-2, показа, че повишаването на антителата срещу hCCCoV предшества откриването на антитела на SARS-CoV-2 (Фигури 3I–3L), което показва, че ранните hCCCoV-реактивни антитела не се свързват с пика на SARS-CoV-2.

Ако корелацията между ранното повишаване на бетакоронавирусните антитела и по-високите SARS-CoV-2 антитела след инфекция се дължи на новосъздадени антитела в отговор на SARS-CoV-2 инфекция, които реагират кръстосано с hCCCoV, а не с връзка с тежестта на заболяването, тогава бихме предвидили, че изходните нива на hCCCoV или повишенията ще имат подобна корелация в отговор на ваксинация при лица, които не са били заразени със SARS-CoV-2. Затова сравнихме изходните нива на hCCCoV антитела при индивиди преди ваксинация с нивото на SARS-CoV-2 антитела след ваксинация. За този анализ нито един от ваксинираните участници не е бил заразен преди това със SARS-CoV-2. Фактът, че всички участници са били проверявани всяка седмица чрез назален тампон и PCR, намалява вероятността лица с асимптоматични инфекции да бъдат включени в тази група. Първо оценихме дали антителата срещу hCCCoV са се увеличили след ваксинация подобно на инфекция. Наблюдавахме увеличение на HKU1 IgG след ваксинация Pfizer/BioNTech BNT162b2 в сравнение с проби, взети на изходно ниво (Фигура S7). Въпреки това, няма значително увеличение на OC43 IgG, както се наблюдава след инфекция със SARS-CoV-2. Освен това увеличението на HKU1 IgG антителата след ваксинация не е толкова голямо, колкото увеличението, наблюдавано при SARS-CoV-2-инфектирани участници. Ние също така отбелязахме значително намаляване на всички hCCCoV IgA и IgM антитела след ваксинация. Важно е, че нито изходните нива на антителата срещу hCCCoV, нито увеличението на антителата срещу hCCCoV след ваксинация корелират с повишените антитела срещу SARS-CoV-2 след ваксинация (Фигури 6D и 6E). Всъщност корелациите на изходното ниво или усилване на hCCCoV антитела и SARS-CoV-2 антитела показват поразително различни модели при заразени срещу ваксинирани индивиди (фигури 6B–6E). Интересното е, че има значителни корелации с изходните hCCCoV IgM и SARS-CoV-2 IgM след ваксинация. Тъй като IgM антителата проявяват по-голяма кръстосана реактивност сред hCCCoV в сравнение с IgG и IgA, това може да отразява съществуващи hCCCoV IgM антитела, които реагират кръстосано със SARS-CoV-2. Като алтернатива, индивиди с по-висок hCCCoV IgM може да имат по-голям дял наивни В клетки, способни да отговорят на нов антиген. Тъй като ваксината не предизвиква силен IgM отговор при повечето индивиди, понастоящем не е известно дали нивата на IgM антитела след ваксинация оказват влияние върху ефикасността на ваксината. Заедно тези данни показват, че съществуващите IgA и IgG на бетакоронавирус корелират с по-висок отговор на антитела към SARS-CoV-2 след инфекция, но не и ваксинация. Тъй като повишените SARS-CoV-2 антитела след инфекция корелират с по-голямо заболяване, тези констатации повдигат възможността съществуващите IgG и IgA на бетакоронавирус да повлияят отрицателно на имунния отговор към SARS-CoV-2, което води до по-голяма продължителност на антигена и следователно повече SARS-CoV-2 антитела.

Предшестваща имунизация с шипови протеини на hCCCoV ограничава отговора на антитялото към SARS-CoV-2 RBD при мишки

Тъй като повечето индивиди имат положителни нива на антитела, специфични за всичките четири hCCCoV (Фигура 1D), не е възможно директно да се провери дали предишното излагане на конкретен hCCCoV влияе върху отговора на антителата към SARS-CoV-2. Затова извършихме серия от имунизации на мишки, които не са имали предишна експозиция на коронавируси. C57BL/6 мишки бяха имунизирани с шипове протеини на SARS-CoV-2, OC43, HKU1, 229E или NL63. Четири седмици по-късно всички мишки бяха имунизирани с шиповия протеин на SARS-CoV-2. По този начин мишките са получили или две имунизации на пика на SARS-CoV-2, или една имунизация на пика на hCCCoV, последвана от една на пика на SARS-CoV-2. Две седмици след имунизацията с пик на SARS-CoV-2, ние измерихме RBD и шипове IgG антитела, за да определим дали предишното излагане на протеини на шип на hCCCoV е повлияло на отговора на антителата към пика на SARS-CoV-2 и RBD. Предишна имунизация с пикови протеини на hCCCoV не е повлияла значително нивата на антитела срещу SARS-CoV-2 шипове с пълна дължина (Фигура 7А). Въпреки това, RBD IgG е значително намален при мишки, които са получили предварителна имунизация с HKU1 и NL63 спайк протеини в сравнение с мишки, имунизирани само с SARS-CoV-2 шипов протеин (Фигура 7B). Важно е, че предишна имунизация с който и да е от пиковите протеини на hCCCoV инхибира неутрализиращи антитела след пикова имунизация срещу SARS-CoV-2, както е открито чрез псевдонеутрализационен анализ (Фигура 7C). Тези данни, които са в съответствие с предишно проучване, използващо различен щам мишки и адювант (Lapp et al., 2021), директно показват, че предишното излагане на hCCCoV спайк протеини има потенциала да инхибира генерирането на неутрализиращи антитела, специфични за RBD на SARS-CoV-2. Заедно тези открития илюстрират, че предишен имунитет към вирус с определена степен на хомология може да попречи на имунния отговор към нов вирус.

Cistanche ползи за мъжете - укрепване на имунната система

ДИСКУСИЯ

Имунният импринтинг се отнася до преференциалното активиране на В-клетки на паметта, които са били генерирани по време на предишна инфекция с антигенно свързан вирус, а не наивни В-клетки, специфични за новия вирус (Guthmiller and Wilson, 2018; Henry et al., 2018; Monto et al. ., 2017). Тази концепция е добре документирана за грипни инфекции, при които хората са многократно изложени на антигенно различни вируси, съдържащи региони на хомоложност. Отпечатването може да попречи на имунитета към нов вирус, ако съществуващи антитела срещу запазени епитопи доминират в имунния отговор, но не неутрализират новия вирус. Тъй като съществуващите В-клетки на паметта присъстват при по-високи честоти на прекурсорите в сравнение с наивните В-клетки и са подготвени да бъдат активирани, те могат да изместят В-клетките, специфични за нови епитопи, и да възпрепятстват имунитета към новия вирус (Cobey and Hensley, 2017). В допълнение, антитела, генерирани от свързан вирус, могат да блокират антитела, специфични за новия вирус чрез пространствено препятствие чрез свързване на запазени епитопи близо до новите епитопи.

Хората се заразяват многократно с ендемични hCCCoV (Edridge et al., 2020; Kiyuka et al., 2018) и нашите данни показват, че почти всеки индивид притежава антитела, специфични за всичките четири ендемични hCCCoV. Скорошно проучване показа, че В-клетките на паметта, специфични за hCCCoVs, доминират ранния имунен отговор след SARS-CoV-2 инфекция; тези антитела обаче не неутрализират SARS-CoV-2 (Dugan et al., 2021). Това проучване илюстрира как имунитетът срещу hCCCoV може да попречи на защитния имунитет срещу SARS-CoV-2 чрез узурпиране на ресурси за усилване на неутрализиращи антитела. Нашите данни са в съответствие с тези констатации, тъй като показваме корелации с изходното ниво или повишаване на hCCCoV антителата и нивата на SARS-CoV-2- 2 антитела след инфекция, което корелира с по-голяма тежест след SARS-CoV-2 инфекция . Експериментите с мишки допълнително потвърдиха, че съществуващият hCCCoV имунитет намалява неутрализиращите антитела, специфични за RBD. Интересно е, че hCCCoV антителата се повишават след инфекция със SARS-CoV-2 и показват ясни корелации с отговора на SARS-CoV-2 антитела, но не влияят значително върху честотата на заразяване или продължителността на симптомите. Тъй като няколко фактора допринасят за чувствителността към инфекция със SARS-CoV-2, включително възраст, пол и основни болестни състояния (Fang et al., 2020), може да е трудно да се открие въздействието на имунитета на hCCCoV върху самоотчетените симптоми наред с други объркващи фактори. Важно е да се отбележи, че участниците в тази кохорта са предимно кавказки жени с леки до умерени симптоми. Следователно не успяхме да оценим задълбочено асоциациите с по-тежко заболяване. Независимо от това, нашите данни предполагат, че имунитетът срещу hCCCoV може да бъде допълнителен фактор, който може да възпрепятства ефективния имунитет към инфекцията със SARS-CoV-2. Като се има предвид продължаващата циркулация на варианти на SARS-CoV-2, ще бъде важно да се проучат допълнително механизмите, при които съществуващият имунитет влияе върху имунния отговор към нов, но свързан вирус.

Фигура 7. Предшестваща имунизация с шипови протеини на hCCCoV ограничава отговорите на антителата към SARS-CoV-2 RBD

Предишни проучвания, изследващи дали антителата срещу hCCCoV допринасят за тежестта на заболяването, дадоха особено противоречиви резултати. Една от основните причини за тези различни заключения е, че в повечето от предишните проучвания липсват базови проби от един и същи индивид преди и след инфекцията. Поради голямото разнообразие в нивата на антителата срещу hCCCoV, не е възможно да се оцени точно изходното ниво на имунитета срещу hCCCoV, без да се анализират проби от всеки индивид преди инфекция със SARS-CoV-2. Важно е, че нашите данни показват, че нивата на hCCCoV антитела могат да се увеличат или намалят още 5 дни след инфекцията със SARS-CoV-2. Следователно пробите, взети след инфекция със SARS-CoV-2, не са показателни за съществуващ имунитет срещу hCCCoV. Друг фактор, допринасящ за различните заключения, е съставът и диапазонът на тежест в различните кохорти. Докато повечето участници в групата на SJTRC показват леки до умерени симптоми, други проучвания включват само хоспитализирани лица. Освен това, антигените, изотиповете на антителата и типът на анализите варират значително сред предишните проучвания, което също може да е повлияло на несъответствието в резултатите.

Съществува широка кръстосана реактивност между антитела, специфични за hCCCoV (Ladner et al., 2020; Poston et al., 2021; Wec et al., 2020) и нашите данни илюстрират как серологията може да не е надежден индикатор за hCCCoV към на които дадено лице е било последно изложено. Това е очевидно в по-голямата корелация между изотиповете на антитела, специфични за различни hCCCoV, отколкото връзка с високи нива на IgA, IgM и IgG, специфични за определен hCCCoV. В съответствие с предишни проучвания ние открихме, че при по-възрастните индивиди имунитетът срещу hCCCoV е по-предубеден към IgA и IgG в сравнение с IgM при по-млади индивиди (Selva et al., 2021). Всеки път, когато индивид е изложен на hCCCoV, В-клетките на паметта се настройват допълнително чрез съзряване на афинитета и клонова селекция, за да генерират hCCCoV-специфични антитела с по-висок афинитет. Съответно, с възрастта на индивидите, повтарящото се излагане на hCCCoVs създава по-специфичен и по-малко адаптивен репертоар от hCCCoV-специфични В клетки на паметта. Тъй като SARS-CoV-2 е нов вирус, с който хората не са се сблъсквали, беше неочаквано, че IgM антителата не предхождат IgG антителата (Фигура S3). Тези данни са в съответствие с предишен доклад и предполагат, че ранният имунен отговор на SARS-CoV-2 е доминиран от повторното активиране на В клетките на паметта, генерирани по време на предишна HCV инфекция (Dugan et al., 2021). Предполагаме, че нивата на антитела IgG и IgA на бетакоронавирус са по-показателни за кумулативния отговор на индивида, отколкото за времето на скорошна инфекция. Съответно, по-високите нива на бетакоронавирус IgG и IgA антитела предполагат по-тесен и по-малко адаптивен репертоар от антитела, което би било от полза за имунитета към hCCCoV, но би било вредно за имунния отговор към нов коронавирус. По този начин, въпреки че по-младите индивиди могат да бъдат изложени на hCCCoVs по-често от по-възрастните индивиди, отклонението на hCCCoV IgM при по-младите участници е в съответствие с по-адаптивния репертоар, което може да обясни защо по-младите индивиди проявяват по-малка тежест на заболяването от по-възрастните индивиди. Въпреки че изходните нива на hCCCoV антитела корелират с нивата на SARS-CoV-2 антитела след инфекция, ние не наблюдавахме връзка между изходния hCCCoV имунитет и SARS-CoV-2 антитела след ваксинация. Много фактори се различават между имунния отговор към ваксинацията и инфекцията. Една възможност е, че съществуващите hCCCoV антитела могат да възпрепятстват генерирането на SARS-CoV-2 неутрализиращи антитела, като по този начин удължат експозицията на вируса и засилят отговора на антителата след инфекция. Въпреки това, инхибирането на неутрализиращи антитела не би повлияло на антигенното натоварване в контекста на ваксинация и следователно имунитетът срещу hCCCoV няма да има подобно въздействие върху инфекцията и ваксинацията. Като алтернатива също е възможно да няма корелация между изходните нива на hCCCoV антитела и нивата на антитела след ваксинация, тъй като иРНК ваксините индуцират толкова силен имунен отговор към шиповия протеин на SARS-CoV-2, че ефикасността на тези ваксините могат да отменят ефекта от отпечатването. Интересното е, че скорошен доклад показа, че импринтингът също води до различни резултати след инфекция с грипен вирус спрямо ваксинация (Dugan et al., 2020). В обобщение, нашите данни показват, че инфекцията със SARS-CoV-2 и ваксинацията активират съществуващите В клетки на паметта, специфични за отличието. Изходните нива на HCV антитела и степента на повишаване на тези антитела след инфекция или ваксинация варират драстично при отделните индивиди. По-високите изходни нива или повишаването на IgG и IgA на бетакоронавирус след инфекция се свързват с повишени нива на антитела срещу SARS-CoV-2, което корелира с по-голяма тежест на заболяването. Тези открития предполагат, че подобно на грипния вирус, предишно излагане на коронавируси с достатъчна хомология може да попречи на имунния отговор към нов коронавирус.

ПРЕПРАТКИ

Aguilar-Bretones, M., Westerhuis, BM, Raadsen, MP, de Bruin, E., Chandler, FD, Okba, NM, Haagmans, BL, Langerak, T., Endeman, H., van den Akker, JP и др. ал. (2021). Сезонно специфичните за коронавирус В клетки с ограничена кръстосана реактивност на SARS-CoV-2 доминират IgG отговора при тежка форма на COVID-19. J. Clin. Инвестирам. 131, e150613.

Allen, EK, Randolph, AG, Bhangale, T., Dogra, P., Ohlson, M., Oshansky, CM, Zamora, AE, Shannon, JP, Finkelstein, D., Dressen, A., et al. (2017). SNP-медиирано прекъсване на свързването на CTCF в IFITM3 промотора е свързано с риска от тежък грип при хората. Нац. Med. 23, 975–983.

Amanat, F., Stadlbauer, D., Strohmeier, S., Nguyen, THO, Chromikova, V., McMahon, M., Jiang, K., Arunkumar, GA, Jurczyszak, D., Polanco, J. и др. . (2020 г.). Серологичен анализ за откриване на сероконверсия на SARS-CoV-2 при хора. Нац. Med. 26, 1033–1036.

Anderson, EM, Goodwin, EC, Verma, A., Arevalo, CP, Bolton, MJ, Weirick, ME, Gouma, S., McAllister, CM, Christensen, SR, Weaver, J., et al.; UPenn COVID Processing Unit (2021). Сезонните човешки коронавирусни антитела се повишават при инфекция със SARS-CoV-2, но не са свързани със защита. Клетка 184, 1858–1864.e10.

Arvin, AM, Fink, K., Schmid, MA, Cathcart, A., Spreafico, R., HavenarDaughton, C., Lanzavecchia, A., Corti, D. и Virgin, HW (2020). Гледна точка за потенциално зависимо от антитела усилване на SARS-CoV-2. Nature 584, 353–363.

Aydillo, T., Rombauts, A., Stadlbauer, D., Aslam, S., Abelenda-Alonso, G., Escalera, A., Amanat, F., Jiang, K., Krammer, F., Carratala, J ., и Garcı´aSastre, A. (2021). Имунологично отпечатване на отговора на антитялото при пациенти с COVID-19. Нац. Общ. 12, 3781.

Becker, M., Strengert, M., Junker, D., Kaiser, PD, Kerrinnes, T., Traenkle, B., Dinter, H., H€aring, J., Ghozzi, S., Zeck, A. , et al. (2021). Изследване отвъд клиничната рутинна серология на SARS-CoV-2 с помощта на MultiCoV-Ab за оценка на кръстосаната реактивност на ендемичния коронавирус. Нац. Общ. 12, 1152.

Cobey, S. и Hensley, SE (2017). Имунна история и чувствителност към грипен вирус. Curr. мнение Virol. 22, 105–111.

Cohen, KW, Linderman, SL, Moodie, Z., Czartoski, J., Lai, L., Mantus, G., Norwood, C., Nyhoff, LE, Edara, VV, Floyd, K., et al. (2021). Надлъжният анализ показва трайна и широка имунна памет след инфекция със SARS-CoV-2 с персистиращи отговори на антитела и В и Т клетки на паметта. Cell Rep Med 2, 100354.

Doban˜o, C., Santano, R., Jime´ nez, A., Vidal, M., Chi, J., Rodrigo Melero, N., Popovic, M., Lo´ pez-Aladid, R., Ferna ´ ndez-Barat, L., Tortajada, M., et al. (2021). Имуногенност и кръстосана реактивност на антитела към нуклеокапсидния протеин на SARS-CoV-2: полезност и ограничения в проучванията за серологично разпространение и имунитет. Превод Рез. 232, 60–74.

Dugan, HL, Guthmiller, JJ, Arevalo, P., Huang, M., Chen, Y.-Q., Neu, KE, Henry, C., Zheng, N.-Y., Lan, LY-L., Tepora, ME, et al. (2020 г.). Съществуващият имунитет оформя различни пейзажи на антитела след инфекция с грипен вирус и ваксинация при хора. Sci. Превод Med. 12, eabd3601.

Dugan, HL, Stamper, CT, Li, L., Changrob, S., Asby, NW, Halfmann, PJ, Zheng, N.-Y., Huang, M., Shaw, DG, Cobb, MS, et al. (2021). Профилирането на В-клетъчната имунодоминантност след инфекция със SARS-CoV-2 разкрива еволюция на антитела към неутрализиращи вирусни цели. Имунитет 54, 1290–1303.e7.

Dugas, M., Grote-Westrick, T., Vollenberg, R., Lorentzen, E., Brix, T., Schmidt, H., Tepasse, P.-R., and K€ uhn, J. (2021a) . По-лекото протичане на COVID-19 се свързва с повишени нива на антитела срещу сезонните човешки коронавируси OC43 и HKU1 (HCoV OC43, HCoV HKU1). Int J Infect Dis. 105, 304–306.

Dugas, M., Grote-Westrick, T., Merle, U., Fontenay, M., Kremer, AE, Hanses, F., Vollenberg, R., Lorentzen, E., Tiwari-Heckler, S., Duchemin, J., et al. (2021b). Липсата на антитела срещу нуклеокапсиден протеин OC43 на сезонния коронавирус идентифицира пациенти с риск от критичен COVID-19. J Clin Virol 139, 104847.

Еделбютел, Д., Лукас, А., Тушински, Дж., Бенгтсон, Х., Урбанек, С., Фраска, М., Луис, Б., Стоукли, М., Мюлейзен, Х., Мърдок, Д., et al. (2021). Създайте компактни хеш-дайджести на R обекти (цялостна R архивна мрежа).

Edridge, AWD, Kaczorowska, J., Hoste, ACR, Bakker, M., Klein, M., Loens, K., Jebbink, MF, Matser, A., Kinsella, CM, Rueda, P., et al. (2020 г.). Защитният имунитет срещу сезонния коронавирус е краткотраен. Нац. Med. 26, 1691–1693.

Fang, X., Li, S., Yu, H., Wang, P., Zhang, Y., Chen, Z., Li, Y., Cheng, L., Li, W., Jia, H., и Ма, X. (2020). Епидемиологични, коморбидни фактори с тежест и прогноза на COVID-19: систематичен преглед и мета-анализ. Стареене (Albany NY) 12, 12493–12503.

Fonville, JM, Wilks, SH, James, SL, Fox, A., Ventresca, M., Aban, M., Xue, L., Jones, TC, Le, NMH, Pham, QT, et al. (2014 г.). Пейзажи на антитела след инфекция с грипен вирус или ваксинация. Наука 346, 996–1000.

Форни, Д., Каляни, Р., Клеричи, М. и Сирони, М. (2017). Молекулярна еволюция на човешките коронавирусни геноми. Тенденции Microbiol. 25, 35–48.

Фокс, Дж. и Вайсберг, С. (2019). An R Companion to Applied Regression (SAGE Publications, Inc.).

Garcia-Beltran, WF, Lam, EC, Astudillo, MG, Yang, D., Miller, TE, Feldman, J., Hauser, BM, Caradonna, TM, Clayton, KL, Nitido, AD, et al. (2021). COVID-19-неутрализиращите антитела предсказват тежестта на заболяването и оцеляването. Клетка 184, 476–488.e11.

Gombar, S., Bergquist, T., Pejaver, V., Hammarlund, NE, Murugesan, K., Mooney, S., Shah, N., Pinsky, BA и Banaei, N. (2021). SARS-CoV-2 инфекция и COVID-19 тежест при лица с предходна сезонна коронавирусна инфекция. Diagn Microbiol Infect Dis. 100, 115338.

Gouma, S., Weirick, ME, Bolton, MJ, Arevalo, CP, Goodwin, EC, Anderson, EM, McAllister, CM, Christensen, SR, Dunbar, D., Fiore, D., et al. (2021). Серомониторен пръстен на медицинския работник разкрива сложни връзки между обикновените коронавирусни антитела и продължителността на симптомите на COVID-19. JCI Insight 6, 150449. Gu, Z., Gu, L., Eils, R., Schlesner, M. и Brors, B. (2014). кръг Внедрява и подобрява кръговата визуализация в R. Bioinformatics 30, 2811–2812. Gu, Z., Eils, R. и Schlesner, M. (2016). Комплексните топлинни карти разкриват модели и корелации в многоизмерни геномни данни. Биоинформатика 32, 2847–2849.

Guo, L., Wang, Y., Kang, L., Hu, Y., Wang, L., Zhong, J., Chen, H., Ren, L., Gu, X., Wang, G., et al. (2021). Кръстосано реактивно антитяло срещу шипов протеин OC43 на човешки коронавирус корелира с тежестта на заболяването при пациенти с COVID-19: ретроспективно проучване. Emerg. Микробите заразяват. 10, 664–676. Guthmiller, JJ и Wilson, PC (2018). Използване на имунната история за борба с грипните вируси. Curr. мнение Immunol. 53, 187–195.

Guthmiller, JJ, Stovicek, O., Wang, J., Changrob, S., Li, L., Halfmann, P., Zheng, N.-Y., Utset, H., Stamper, CT, Dugan, HL, et al. (2021). Тежестта на инфекцията SARS CoV-2 е свързана с превъзходния хуморален имунитет срещу шипа. MBio 12, e02940-20. Henry, C., Palm, AE, Krammer, F. и Wilson, PC (2018). От първоначалния антигенен грях до универсалната ваксина срещу грипен вирус. Тенденции Immunol. 39, 70–79.

Henss, L., Scholz, T., von Rhein, C., Wieters, I., Borgans, F., Eberhardt, FJ, Zacharowski, K., Ciesek, S., Rohde, G., Vehreschild, M., et al. (2021). Анализ на хуморалните имунни отговори при пациенти с тежък остър респираторен синдром Coronavirus 2 инфекция. J. Инфектирайте. дис. 223, 56–61.

Хикс, Дж., Клумп-Томас, К., Калиш, Х., Шунмугавел, А., Мехалко, Дж., Денсън, Дж.-П., Снейд, К.Р., Дрю, М., Корбет, К.С., Греъм, BS, et al. (2021). Серологична кръстосана реактивност на SARS-CoV-2 с ендемични и сезонни бетакоронавируси. J. Clin. Immunol. 41, 906–913.

Ирен, Г. (2020). TestCor: FWER и FDR контролни процедури за множество корелационни тестове (Comprehensive R Archive Network). Ивазаки, А. и Янг, Й. (2020). Потенциалната опасност от неоптимални отговори на антитела при COVID-19. Нац. Rev. Immunol. 20, 339–341.

Касамбара, А. (2021). rstatix: Удобна за канали рамка за основни статистически тестове (Comprehensive R Archive Network). Kassambara, A. и Mundt, F. (2017). Пакет 'факто екстра'. Извлечете и визуализирайте резултатите от многовариантни анализи на данни (Comprehensive R Archive Network).