Изследване на механизма на действие на общите гликозиди Cistanche върху възпалителни заболявания на червата въз основа на мрежова фармакология и експерименти с животни Ⅲ

Mar 29, 2024

3 Резултати и анализ

3.1 Анализ на целите на общите гликозиди на Cistanche tubulosa и цели на заболяването

Импортирайте файловете с триизмерна структура наактивни съставкив базата данни PharmMapper, за да получите съответните целеви точки, съответстващи на различни съставки. Базата данни UniProt беше използвана за получаване на името на протеина и информацията за името на гена, съответстваща на всяка цел. Комбинирайки целевите точки, съответстващи на седемте компонента, бяха получени общо 354 цели. В базата данни GeneCards бяха търсени съответните гени с помощта на ключовата дума „възпалително заболяване на червата“ и резултатите от търсенето бяха сортирани и накрая бяха получени 7851 цели. Използвайте събития, за да начертаете диаграма на Venn онлайн, за да получите пресечната точка на целите на активната съставка на Cistanche tubulosa и целевите точки на IBD. Както е показано на фигура 1, 254 цели на активната съставка наCistanche tubulosaкоито имат защитен ефект върху IBD.

CISTANCHE SUPPLEMENT FOR IBD TREATMENT

CISTANCHE SUPPLEMENT FOR IBD TREATMENT

CISTANCHE SUPPLEMENT FOR IBD TREATMENT

Фиг.2 PPI-мрежова диаграма на общи цели


CISTANCHE SUPPLEMENT FOR IBD TREATMENT

CISTANCHE SUPPLEMENT FOR IBD TREATMENT

Фиг.5 Мрежа компонент-цел-път


CISTANCHE SUPPLEMENT FOR IBD TREATMENT

Фиг.7 Общите гликозиди на Cistanche tubulosa регулират надолу mRNA на TGF- и mTOR сигналните пътища при IBD мишки

cistanche for inflammatory bowel (10)


3.4 Общите гликозиди на Cistanche tubulosa подобряват DAI резултата, индуциран от DSS

Резултатите от теста показват, че с изключение на CZ групата, другите три групи имат различна степен на загуба на тегло и фекална окултна кръв (Фигура 6). Сред тях контролната група на DSS има най-висока степен на загуба на телесно тегло, най-тежка фекална кръв, най-висок DAI и очевидно фекално кървене на 6-ия ден. След намесата на общите гликозиди на Cistanche tubulosa, DAI резултатът постепенно намалява и ситуацията с окултната кръв постепенно намалява. HZ групата има най-ниската степен на загуба на телесно тегло и най-ниското количество скрита кръв в изпражненията. Резултатите показват, че общите гликозиди на Cistanche tubulosa подобряват физиологичните реакции, причинени от възпалително заболяване на червата.

Echinacoside in cistanche (8)

cistanche order

CISTANCHE ДОБАВКА ЗА ЛЕЧЕНИЕ НА IBD PHGS75% ECH 30% ACT 12%


3.5 Общите гликозиди на Cistanche tubulosa намаляват IBD

Експресия на mTOR и TGF-сигнални пътища в миши далак mTOR и TGF-сигнални пътища са два важни сигнални пътя, които активират възпалителни реакции. Експресията на mTOR и TGF- в тъканта на далака на мишки се открива чрез qRT-PCR. Резултатите показват, че експресията на mRNA на mTOR и TGF- в DSS контролната група мишки е значително повишена в сравнение с тази при нормалните мишки. В сравнение с DSS контролни мишки, В сравнение с Cistanche tubulosa, експресията на mTOR и TGF- в мишки е значително намалена след интервенция на Cistanche tubulosa. Сред тях групата с висока доза има най-значително намаление и нивото на експресия е основно в съответствие с това на нормалната група (Фигура 7). Резултатите показват, че общите гликозиди на Cistanche tubulosa регулират надолу експресията на mTOR и TGF-сигналните пътища.

image

Фиг.8 Топлинна карта на PICRUSt2-функционалното групиране на изобилие


3.6 Функционален анализ на анотациите на PICRUSt2

PICRUSt2 е биоинформатичен инструмент за прогнозиране на метагеномна функция въз основа на информация за биологична 16S rRNA, ASV дърво и ASV генна информация в базата данни Greengene. Изберете COG база данни е използвана за функционално прогнозиране и резултатите показват, че функциите на чревната флора включват главно обработка на РНК; структура и динамика на хроматина; контрол на клетъчния цикъл, клетъчно делене, хромозомна сегментация; защитен механизъм; сигнализиране на биогенеза на клетъчна стена/клетъчна мембрана/обвивка; клетки Има повече от 20 функции като извънклетъчна структура; вътреклетъчен транспорт, секреция и транспорт на везикули; производство и преобразуване на енергия; въглехидратен транспорт и метаболизъм. Изберете 15-те най-разпространени характеристики и информация за тяхното изобилие във всяка пробаНачертава се топлинна карта (Фигура 8) за информацията и се клъстерира от различни функционални нива.

В сравнение с групата CZ, мишките от контролната група DZ имат COG1132 (ABC-тип система за транспортиране на множество лекарства), COG0745 (регулатор на ДНК-свързващия отговор), COG1131 (система за транспортиране на множество лекарства от тип ABC), COG1961 (специфична за мястото ДНК рекомбиназа, свързана с ДНК инвертаза Pin ), COG0438 (включена гликозилтрансферазав биосинтезата на клетъчната стена), COG0534 (Na +-управляванмултилекарствена ефлуксна помпа), COG0642 (хистидин киназа за сигнална трансдукция), COG1595 (специализирана сигма субединица на ДНК-насочена РНК полимераза), COG0463 (ендонуклеаза), COG4974 (сайт-специфична рекомбиназа XerD), COG2207 (AraC-тип ДНК свързващ домейн и AraC - съдържащи протеини), COG1136 (ABC-тип липопротеинова експортна система) и COG1309 (ДНК-свързващ транскрипционен регулатор) аномалии на функционална генна експресия. Тези гени участват главно в: V: защитен механизъм; T: механизъм за предаване на сигнала; M: биогенеза на клетъчна стена/клетъчна мембрана/обвивка; I: липиден транспорт и метаболизъм; К: транскрипция; L: репликация, рекомбинация и възстановяване.

Flavonoid (8)

След като на тези шест функции бяха дадени общи гликозиди на Cistanche tubulosa, експресията на тези различни физиологични функции беше близка до тази на нормалната група. В сравнение с мишките в групите CZ и DZ, мишките в групата HZ имат висока експресия на гени COG1028 (фамилия алкохолна дехидрогеназа с къса верига) и COG0451 (нуклеозид-фосфат-захарна епимераза). Тези два гена са свързани с I: липиден транспорт и метаболизъм. И M: Функциите на биогенезата на клетъчната стена/клетъчната мембрана/обвивката са тясно свързани. Следователно се спекулира, че общите гликозиди на Cistanche tubulosa могат да регулират увреждането на IBD мишки чрез регулиране на липидния метаболизъм, метаболизма на глюкозата и свързаните механизми за трансдукция на защитни сигнали при мишки.

Flavonoid (15)


Може да харесаш също